Anne-Sophie Valin

- Membre du département Life Sciences R&D
Participation au programme Biointelligence PLM (Product Life Cycle Management)
Ce programme est piloté par Dassault Systemes, il bénificie de la participation de 5 grands groupes pharmaceutiques et plusieurs laboratoires académiques.
L'objectif du programme est le développement d'une plate-forme logicielle intégrée et dédiée à la découverte et le développement de médicaments

- En charge du développement d'un éditeur de pathway biologique

- Innovation en matière d'expérience utilisateur, et de création d'interfaces homme-machine addictives

Technologies utilisée : Logiciel CATIA, C++

- Développement d’un outil standalone dédié à la visualisation génomique et l’exploration des données de puce à ADN (Analyse et spécification des besoins, rédaction cahier des charges, conception, développement, rédaction de la documentation utilisateur, support utilisateur, conception d'un site web dédié au logiciel). Diffusion et publication en cours.
- Réalisation du site web institutionnel du programme http://cit.ligue-cancer.net/

Technologies : Windows/Mac os X, Java, Swing, XML, package JFreeChart, JSP, Servlet, SQL, Joomla, Netbeans, SVN

- Conception et implémentation en JAVA d’un algorithme pour la comparaison d’échantillons tumoraux
- Développement d’une application pour l’aide à la mise à jour d’annotations de puces commerciales

Technologies : Windows, Python, Java, Eclipse, SVN

- Développement d’un outil de recherche de modèles complexes dans des séquences génomiques basé sur la notion d’arbre des suffixes. Elaboration d’une interface Web pour cet outil: http://genoweb1.irisa.fr/Serveur-GPO/outils/pat...
- Réalisation d’interfaces web avec plus value d’outils de bioinformatique (Réalisation de suites logiciels, rédaction de documentations utilisateur), disponibles sur le site de la plate-forme : http://genouest.org
- Développement d'un outil de recherche de répétitions maximales dans les génomes basé sur la notion d'arbre des suffixes généralisés
- Signataires de plusieurs articles scientifiques

Technologies : LINUX/UNIX, Python, biopython, PHP, Perl, javascript, C, java, apache, cgi-bin, docbook, latex, spip, eclipse, SVN

- Développement de parseurs XML pour les banques de données : Swiss-Prot, TrEMBL et Interpro, population d’une base de données et interfaçage web de la base de données.

Technologies : LINUX, Java, JSP, Servlet, PostgreSQL, tomcat, UML, IntelliJ, CVS

Découverte de gènes candidat pour la maladie de Parkinson (Utilisation des données du NCBI)