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Armelle AUTRET

MONT-SAINT-AIGNAN

En résumé

Mes compétences :
Organisation du travail
Microsoft Office
Microbiologie
Travail en équipe
Biologie moléculaire
Gestion de projet
Esprit de synthèse
Veille scientifique et technologique
Biostatistiques
Bonnes Pratiques de Laboratoire

Entreprises

  • Lycée Professionnel Agricole Privée Gabriel Bridet à ANET - Formatrice en BTSA Analyses Agricoles, Biologiques et Biotechnologiques

    2017 - maintenant Modules enseignés à des élèves en alternance :
    - Statistiques liés aux traitements de données expérimentales (tests d'hypothèses, loi de probabilité ou de variables aléatoires, modélisation simple des données)
    - Gestion et organisation du laboratoire: analyser les exigences des référentiels qualité selon le secteur d'activité
    - Contrôle : identifier les enjeux et la nécessité des contrôles réglementaires; comprendre l'intérêt des normes et des contrôles analytiques
    - Analyse: Identifier les différentes étapes d'une analyse biologique, afin de l'optimiser, à partir du choix de la méthode, des techniques de préparations ou de prélèvements; raisonner la mise en oeuvre des contrôles intra-analytique
    - Méthodes instrumentales appliqués: identifier les principales caractéristiques des composés chimiques ou biologiques afin de choisir la meilleure méthode analytique; maîtriser les principes des méthodes
    - Application analytique dans des secteurs d'activités professionnelles: mettre en oeuvre les contrôles et les analyses appliqués aux secteur professionnels
    - Procédés biotechnologique: Analyser et mettre en oeuvre des procédés biotechnologiques; raisonnés les procédés biotechnologiques en s'appuyant sur les organismes vivants utilisés; expliquer les principes des procédés de production
    - Projet expérimental: construire, à partir d'un thème d'étude ou de recherche, un projet concrétisé par un protocole expérimental à mettre en oeuvre; analyse des données obtenues; mise en forme en rendu didactique et synthétique

    Activités annexes:
    - Préparations des travaux pratiques, suivi des commandes associés, gestion du matériel et des consommables
    - Suivi d'apprentis sur leurs lieux de travail (en entreprise agro-alimentaire, pharmaceutique, cosmétique et environnementale, ainsi qu'en laboratoire de biologie médicale)
    - Réalisation de contrôles de certifications (sujets (oral, écrit et pratique) et correction)
    - Jury d'examen pour l'obtention du diplômes BTSA ANABIOTEC (correction de rapports, et oraux supervisés)
  • 9th Symposium for European Fresh Water Sciences - Communication affichée en anglais

    2015 - 2015 9ème Symposium européen de la SEFS (Symposium for European Fresh Water Sciences) à Genève (5-10 Juillet 2015)

    Présentation affichée en anglais des travaux de recherche :
    Adaptation of periphytic communities to copper and silver in an artificially-controlled exposure.

    Autret A, Roger F, Uher E, Friedel I, Berthe T, Fechner L-C, Petit F.
    UMR 6143 CNRS M2C Rouen et UR HBAN Irstea Antony
  • SETAC Europe 25th Annual Meeting - Communication orale en anglais

    2015 - 2015 25ème Symposium européen de la SETAC (Society of Environmental Toxicology and Chemistry) à Barcelone (3-7 Mai 2015)

    Présentation orale en anglais des travaux de recherche :
    Adaptation of periphytic communities to copper and silver in an artificially-controlled exposure.

    Autret A, Roger F, Uher E, Friedel I, Berthe T, Fechner L-C, Petit F.
    UMR 6143 CNRS M2C Rouen et UR HBAN Irstea Antony
  • Laboratoires UMR 6143 CNRS M2C Rouen /UR HBAN Irstea Antony - Chargé de projets junior - Doctorat

    2012 - 2016 Thèmes de recherche
    UMR 6143: Etude de la vulnérabilité des hydrosystèmes à la pression anthropique: i) adaptation des communautés microbiennes à la contamination chimique; ii) devenir et dynamique de transfert des bactéries pathogènes

    UR HBAN: Mesure des réponses biologiques du biote face aux pressions chimiques exercées par les activités humaines pour prédire les perturbations biologiques des milieux aquatiques

    Résumé du projet de thèse:
    Étude de l'impact des métaux sur la composante bactérienne d'un biofilm de rivière : caractérisation de la diversité bactérienne, de l'expression de mécanismes de résistances et des fonctions métaboliques exercées.
    Cette étude m'a permis de me former à la gestion de projet, de prendre des responsabilités (encadrement, organisation) et d'être polyvalente au sein des deux équipes de recherche

    Compétences professionnelles acquises:
    • Gestion de projets de recherche, planification du travail, supervision du personnel, de stagiaires en Master et des besoins techniques (gestion des stocks, des commandes et réservation du matériel)
    • Veille technique et scientifique, capacité de synthèse, reporting des résultats, respect des délais
    • Suivi et recueils des données expérimentales, rédaction de rapports d’essai, valorisation des données (posters, présentations scientifiques)
    • Synthèses et présentations orales des travaux en anglais lors d’un congrès international (SETAC)
    • Notions de bio-informatique : traitement de données de séquençage 16S NGS par Qiime (diversité bactérienne), software R (statistiques, analyses multi-variées)

    Expériences techniques acquises:
    • Piloter un projet technique: conception du protocole, génération des données, traitement et analyses des résultats
    • Expériences en suivi qualité des équipements, des protocoles et des procédures
    • Etudes in situ et en microcosmes (impact d'exposition métallique en milieu contrôlé) de biofilms naturels complexes (bactéries, algues…): organisation de campagne de prélèvements, planification et suivis continus d'expériences à long terme (4 à 5 semaines en continues).
    • Biologie moléculaire: extraction ADN-ARN sur diverses matrices, qPCR, design d’amorces, clonage moléculaire
    • Écotoxicologie: approches PICT (mesure de tolérance de communautés) et MicroResp (profils métabolique)
    • Autres: Analyses physico-chimiques (eau), microscopie à épi-fluorescence (Dead/life, observation de la structure du biofilm), micro GC (dosage de CO2), spectrométrie d'absorbance atomique (SAA, dosage/quantification de métaux)
  • UMR 5557 Ecologie Microbienne - Assistante de recherche

    2012 - 2012 L'UMR 5557 regroupe 8 équipes de recherche et 5 plateformes techniques
    Thèmes de recherche de l'équipe Rhizosphère:
    *Caractérisation des propriétés génomiques, physiologiques et écologiques des bactéries symbiotiques des plantes. *Étude des mécanismes bénéfiques sur la plante hôte des bactéries phyto-stimulatrices et phyto-protectrices
    *Place des bactéries symbiotiques au sein de la communauté microbienne rhizosphérique et leur rôle dans le fonctionnement microbien des écosystèmes.


    Sujet de recherche:
    Caractérisation par puce à ADN de la communauté bactérienne rhizosphérique associée à une barrière végétale au Sahel (projet de la Grande Muraille Verte).
    Comparaison de la diversité bactérienne et de groupes fonctionnels entre sols colonisés ou non, et en fonction de l’âge des arbustes ciblés.

    Compétences professionnelles acquises:
    • Veille technique et scientifique, capacité de synthèse, rédaction de rapports d'essais et d'avancements des recherches, conduite d'études, présentation des résultats de manières synthétique
    • Développer des méthodes d'analyses et approches scientifiques, résoudre un problème le cas échéant
    • Maîtrise des outils informatiques : software R (statistiques, analyses multi-variées), software de traitement de données des puces

    Expériences techniques
    • Fondamentaux de microbiologie: BPL, cultures bactériennes du sol (trois milieux testés dont un spécifique pour cibler les productrices exo-polysaccharides), travail sous PSM, notions en HPLC
    • Biologie moléculaire: extraction et purification ADN-ARN, RT-PCR, puces taxonomique ADN 16S,
  • UR Biotechnologie et Signalisation Cellulaire IREBS - Assistante technique

    2011 - 2011 Institut de Recherche de l'Ecole de Biotechnologie de Strasbourg est un regroupement de 3 structures de recherche dont l’UMR 7242 (UR BSC)
    Thèmes de recherche UR BSC:
    *Mécanismes moléculaires impliqués dans l’assimilation du fer chez Pseudomonas aeruginosa (sidérophore)
    *Spécificité du complexe sidérophore/métal pour l'élaboration de nouveaux procédés de bioremédiation des effluents liquides contaminés
    *Définition de nouvelles cibles biologiques pour des antibiotiques innovants contre Pseudomonas aeruginosa

    Sujet de recherche:
    Analyse par fluorescence de l'interaction entre les métaux et les sidérophores au sein d'un biofilm bactérien de Pseudomonas aeruginosa. Etude des différences spécifiques du complexe en fonction du métal testé.
    Comparaison entre souches bactériennes (Pseudomonas) de la spécificité du complexe.

    Compétences professionnelles acquises:
    • Coordination d'une expérience à chaque étape du processus, planification des expériences transverses, synthèse et présentations des travaux d'études
    • Bonnes pratiques de laboratoires sous qualité (BPL), optimisation d'une expérience (veille scientifique)
    • Optimisation des cultures en microplaque du biofilm et l'extraction du sidérophore du biofilm
    • Microbiologie: Culture bactérienne liquide, suivi de croissance par spectrophotométrie, purification de protéines sur résine, lyophilisation
    • Spectre de fluorescence : observer la chélation de la protéine-sidérophore avec le métal (extinction de la fluorescence ou non)
  • UR Biotechnologie et Signalisation Cellulaire IREBS - Assistant technique (L3)

    2010 - 2010 Institut de Recherche de l'Ecole de Biotechnologie de Strasbourg est un regroupement de 3 structures de recherche dont l’UMR 7242 (UR BSC)
    Thèmes de recherche UR BSC:
    *Mécanismes moléculaires impliqués dans l’assimilation du fer chez Pseudomonas aeruginosa (sidérophore)
    *Spécificité du complexe sidérophore - métal pour l'élaboration de nouveaux procédés de bioremédiation des effluents liquides contaminés
    *Définition de nouvelles cibles biologiques (voies de transport du fer) pour des antibiotiques innovants contre Pseudomonas aeruginosa

    Sujet de recherche:
    Établissement d'une banque de sidérophores produits pour assimiler le fer par différentes Pseudomonas fluorescentes.
    Culture de 72 souches de Pseudomonas en milieu pauvre en fer pour obtenir leur sidérophore correspondant (protéines)

    Compétences professionnelles acquises:
    • Coordination d'une expérience à chaque étape du processus, planification des expériences transverses
    • Bonnes pratiques de laboratoires sous qualité (BPL), résoudre un problème technique
    • Microbiologie: Culture bactérienne liquide (milieu LB et minimum) pour production de protéines d'intérêts, suivi de croissance par spectrophotométrie, purification de protéines sur colonne
    • Conservation des lyophilisats, hiérarchisation et mise en place d'une banque d'échantillons
  • Particulier - Summer Au Pair

    2006 - 2008 Juin - Août 2006 et Juillet - Août 2008
    Garde de deux enfants, âgés de 6 et 11 ans (Virginie, USA)

    Juin - Août 2007
    Garde d'un garçon de 12 ans (Munich, Allemagne)

    - Compétences linguistiques - communication orale en anglais et en allemand - amélioration du niveau linguistique
    - Connaissances de la culture américaine et allemande
    - Planification, gestion du temps, résolution de problèmes, management de personnes (pour les plus âgés)
    - Qualités: curiosité, persévérance, ouverture d'esprit, autonomie

Formations

  • Centre De Langues Du Greta Colmar/Sprachschule Zum Ehrstein Fribourg

    Colmar Fribourg 2016 - 2016 DCL - B1

    Acquérir un niveau en langue suffisant pour interagir professionnellement en Allemand:
    * remise à niveau, consolider les acquis de la langue
    * communiquer par téléphone, échanger des informations à l'écrit
    * socioculturel et sociolinguistique
    * se positionner sur des offres d'emploi de pays germanophones

    Obtention du niveau B1 par le biais du Diplôme de Compétence en Langue (DCL), conçu pour répo
  • Université De Rouen-Normandie

    Mont Saint Aignan 2012 - 2015 Doctorat en Ecologie Microbienne

    Doctorat - cf chargée de projets - junior

    Formation professionnelle suivie (proposée par l'Université)
    * Anglais: Acquérir un niveau suffisant pour interagir professionnellement et scientifiquement en Anglais
    * Management: Acquérir les bases de management de personnes et d'un projet
    * Autoclave: être capable d'utiliser un autoclave, connaissances des règles et procédures de sécurité
  • Université Claude Bernard Lyon 1 UCBL (Villeurbanne)

    Villeurbanne 2011 - 2012 Master 2

    Enseignements suivis :
    * Concepts généraux et méthodologie en écologie microbienne (génomique comparative et phylogénie par exemple)
    * Interactions micro-organismes – hôte (bactéries pathogènes et phytopathogènes, interaction communautaire (microbiote, biofilm), résistance aux antibiotiques)
    * Écosystème microbiens (écotoxicologie, vecteurs de maladies, épidémiologie)
  • Université Nancy 1 Henri Poincaré

    Vandoeuvre Les Nancy 2010 - 2011 Maitrise

    Enseignements suivis :
    * Organisation, dynamique et expressions des génomes microbiens, évolution taxinomique
    * Adaptation aux stress environnementaux, physiologie et biochimie microbienne
    * Interaction plantes/hôte – micro-organismes, communauté microbienne (biofilms)
    * Techniques d’études microbienne (BPF, qualité, hygiène et sécurité, génie des procédés, fermenteur de production, culture cel
  • Université Strasbourg 1 Louis Pasteur

    Strasbourg 2006 - 2010 Licence de Biologie Cellulaire et Physiologie

    Enseignements suivis :
    * Biologie cellulaire (voies métaboliques, enzymologie, mécanismes cellulaires et techniques d’études),
    * Biochimie et chimie organique (techniques d'études)
    * Microbiologie (alimentaire, médicale et environnementale; techniques d'identifications des micro-organismes)
    * Génétique des procaryotes et eucaryotes
    * Ecologie (notions de base, gestion de l'eau...)
    * Physiologie

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