Aude-Agnès BLANCHOIN GUILHON

• Caractériser aux niveaux moléculaire et fonctionnel des effecteurs protéiques de Salmonella de l’appareil de sécrétion de type IIII.
-> Clonage par la technologie Gateway, production et purification de protéines, essais de cristallisation (robot nano-gouttes), infection/transfection de lignées cellulaire, microscopie à fluorescence et confocale, pull-down, co-immunoprécipitation, BRET

• Réaliser des mutants de Salmonelles, et tester la virulence in vivo chez la souris.
-> Marquage de gènes sur le chromosome bactérien par la technique ‘one step gene disruption’, délétion de gènes par transduction du P22, infection de souris par injection IP ou gavage

• Définir l’environnement vacuolaire et les mécanismes d’adaptation de Salmonella à son hôte par le test de biosenseurs.
-> Production de cellules dérivées de la moëlle osseuse, infection de macrophages, cytométrie de flux (FACS Canto II - BD), croisements, sevrages et génotypage de souris

The Virulence Protein SopD2 Regulates Membrane Dynamics of Salmonella-Containing Vacuoles. Schroeder N. et al, PLoS Pathogens. 2010
Salmonella detoxifying enzymes are sufficient to control the host oxidative burst. Aussel L. et al, Mol Microbiol. 2011
Sensing and adaptation to low pH mediated by inducible amino acid decarboxylases in Salmonella. Viala JPM. Et al, PLoS ONE. 2011

Identifier des anomalies chromosomiques pour le diagnostic de maladies génétiques.
-> Elaboration de caryotypes, application des techniques de FISH et de CGH-arrays

Optimiser et valider le protocole Aquagen de détection de pathogènes dans l’eau par la technologie des puces à ADN Affymétrix.

Produire des protéines recombinantes solubles en appliquant un plan d’expériences fractionné.

Green fluorescent protein and factorial approach: an effective partnership for screening the soluble expression of recombinant proteins in Escherichia coli. Coutard B. et al, Protein Expr Purif. 2008