Bérengère POCACHARD
Ingénieur Biotechnologies, ESIL
Ingénieur Biotechnologies junior – Ecole supérieure d’ingénieurs de Luminy (ESIL). Actuellement Ingénieure de Recherche dans le service de génétique chromosomique, Prof Levy, La Timone enfant.
Stage de fin d’études : Inodiag – Entreprise de biotechnologies et nanotechnologies.
Après obtention de ma licence de Biochimie physiologie neurosciences, j’ai souhaité intégrer l’ESIL département Biotechnologies pour recevoir une formation d’avantage technique et qui me permettrait d’accéder rapidement à des fonctions managériales.
J’ai réalisé mon stage de fin d’études au sein de l'entreprise Inodiag (développe des microarrays à protéines pour le diagnostic sérologique) où j'ai eu l’opportunité de gérer un projet en quasi-totale autonomie : développement d’un nouvel outil diagnostic.
Actuellement en poste à l'hôpital de la Timone, mon projet se définit comme l’étude génétique d’une cohorte de 250 patients sélectionnés pour leurs troubles de type autistique. Pour ce projet, je suis amenée à utiliser différentes techniques de biologie moléculaire (puces à ADN Agilent, qPCR, FISH...) qui par leurs spécificités et leurs résolutions différentes, garantissent un diagnostique sûr et précis.
Je suis à la recherche d’un poste d’ingénieur R&D ou d’études, dans une entreprise/équipe dynamique et misant sur l’innovation. Très attirée également par le domaine de la qualité, et ayant effectué un stage dans ce domaine, je serais très intéressée par un poste d'ingénieur Assurance Qualité.
Mobilité : PACA, Rhône-Alpes, Languedoc-Roussillon, Ile de France
Disponibilité : Juin 2010
Anglais : Toeic 840/990
Coordonnées : berengere.pocachard@gmail.com
52 contacts2009 - 2010Etude du profil génétique (puces à ADN, qPCR, FISH) d’une cohorte d’environ 200 patients présentant des troubles autistiques.
Objectifs :
- Extraction et purification des ADN de patients
- Analyse des ADN sur puces ADN haute résolution
- Contrôle des anomalies détectées par qPCR
- Préparation des BACs marqués pour les contrôles d’anomalies avec la technique FISH.
- Veille bibliographique sur l’autisme et les gènes présentant une anomalie dans la cohorte
- Rédaction de procédures (accréditation du laboratoire).
Techniques :
- extraction saline d’ADN génomique à partir de sang,
- purification (QIAamp DNA Micro Kit),
- contrôles qualités sur Nanodrop (Thermo Scientific) et Bioanalyzer 2100 (Agilent),
- digestion par enzymes de restriction,
- marquage de l’ADN avec fluorochromes (cyanines),
- concentration d’ADN avec SpeedVac (Thermo Scientific),
- hybridation sur puces à ADN Agilent (244K, 4x180K, 2x400K) puis analyse des résultats sur logiciel DNA Analytics,
- design de primers,
- qPCR (7500 Fast Real-Time PCR System),
- culture bactérienne,
- extraction de BACs,
- marquage d’ADN par Nick Translation (Abbott) avec dUTP Spectrum Orange et Green,
- hybridation in situ (FISH) sur préparations chromosomiques (Hybrite d’Abbott),
- analyse des hybridations par lecture en microscopie à fluorescence.
Résultats en cours : Cohorte étudiée à 70%, plusieurs patients présentent des anomalies (duplications ou délétions) en cours de contrôle par qPCR et FISH.
2008 - 2008Développement de kits de diagnostic in vitro pour la sérologie.
Objectifs du stage : assurer la phase de développement du projet InoMust12 :
- définition et mise en place du planning du projet
- réalisation de puces à protéines (diagnostic in vitro) sur un nouveau type de support
- évaluation de la compatibilité de l’Arrayer Affymétrix pour la production des nouvelles puces
- validation et paramétrage d’un automate d’incubation type X-Y pour l’incubation des nouvelles puces.
- mise au point de protocoles d’incubation manuelle et automatisée
- réalisation de l’analyse des risques (dossier de conception des puces InoMuS.T.12).
Résultats obtenus : évaluation de l’Arrayer achevée, paramétrage et validation de l’automate X-Y finalisés, mise au point de protocoles d’incubation performants. Analyse des risques validée.
2007 - 2007Objectifs du stage : Création d’enzymes artificielles : construction de gènes hybrides par recombinaison homologue chez la levure S. cerevisiae, criblage et optimisation de procédés.
Techniques utilisées : PCR, transformation de levures et bactéries, extraction de plasmides, électrophorèse sur gel d’agarose, extraction d’ADN sur gel et restriction enzymatique.
Résultats obtenus : Transformations de levures réussies, mais aucune enzyme artificielle obtenue. Premiers résultats de l’optimisation encourageants.
2006 - 2006Stage effectué au sein du service qualité et produits. Objectifs du laboratoire : Contrôle de la qualité des matières premières, intermédiaires et des produits finis, respect du cahier des charges et de la norme ISO 9001. Objectifs du stage : Réaliser des échantillons représentatifs de blés et farines, réaliser des analyses physicochimiques sur échantillons et enfin veiller à la traçabilité des échantillons réalisés puis analysés.