Denis Desoubzdanne

Je suis actuellement chargé d'études et de recherche au sein de Profilomic, start-up du CEA créée en 2010 et spécialisée en analyse métabolomique par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse à haute résolution.

Dans le domaine de la santé, nous proposons notre expertise dans la recherche de biomarqueurs prédictifs de pathologies telles que l'oncologie, l'urologie ou les maladies neuro-dégénératives, ainsi que dans l'étude de candidats médicaments sur le métabolisme. Nous travaillons aussi bien sur des tissus biologiques (organes, bactéries et cellules en culture notamment) que sur des biofuides (urines, plasmas et liquides céphalo-rachidiens).

Dans les domaines de l'environnement et de l'agroalimentaire, nous constituons une banque de données de xénobiotiques (pesticides, drogues et médicaments) et de leurs métabolites la plus exhaustive possible afin de caractériser ces composés présents à l'état de trace dans des échantillons d'eaux ou dans des produits alimentaires tels que le miel. L'objectif est de pouvoir alerter les consommateurs, les pouvoirs locaux et/ou les industriels sur la présence non-désirée de ces xénobiotiques et potentiellement dangereux pour l'homme. Une approche semi-quantitative nous permet de confirmer si ces composés se trouvent à des quantités proches de leur LMR autorisée ou non.

J'ai eu pour mission au cours de mon doctorat de mener à bien un projet scientifique. Cela consistait à travailler avec plusieurs chercheurs publics et privés dans le domaine de l'oncologie. Nous avions pour objectif d'identifier des biomarqueurs de radiorésistance aux niveaux métabolomique (RMN 1H), lipidomique et transcriptomique, dans des lignées cellulaires de glioblastomes.

A travers ce stage de M2R, j'ai eu pour mission de synthétiser des streptocyanines, colorants cationiques à chaîne polyméthine. Ces composés avaient la particularité de présenter une bonne activité anti-paludique in vitro. Avec l'aide du laboratoire de Pharmacochimie des Substances Naturelles et Pharmacophores Redox (UMR 152 IRD-UPS), j'ai participé à la détermination du mode et du moment d'action de ces composés sur le parasite P. falciparum. Ce travail a été prolongé par une autre doctorante et a été valorisé par une publication dans le journal "Chemical and Medical Chemistry" en 2009.

La mission qui m'a été confiée à consisté à extraire, isoler et charactériser des molécules présentant une activité anti-paludique, à partir d'une éponge marine. J'ai ainsi pu participer à l'identification de quatre nouveaux composés, présentant finalement une activité anti-paludique modérée. Ce travail a été valorisé par une publication scientifique par une publication dans le journal "Journal of Natural Products" en 2008.