Florian Chain
Ingénieur de recherche, INRA
Bonjour,
j'ai travaillé jusqu'ici essentiellement dans le domaine de la santé des plantes. Cependant, je me suis réorienté depuis et et je travaille maintenant dans le cadre d'une autre thématique de recherche concernant les bactéries probiotiques.
Je bénéficie maintenant d'une bonne expérience dans divers environnements de travail et m'estime facilement adaptable. Je suis l'auteur d'une dizaine de publications scientifiques en anglais et j'ai participé à la rédaction d'un brevet. Vous trouverez des informations plus détaillées sur mon parcours ci-dessous.
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Parcours
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Je situe le début de ma carrière professionnelle à la fin de mes études d'ingénieur agronome, effectuées à l'école nationale supérieure d'agronomie et des industries alimentaires de Nancy.
Mon premier travail de recherche d'importance a été réalisé au cours d'une thèse portant sur un virus de plantes et sa capacité à évoluer.
Ma carrière s'est ensuite poursuivie au Canada, où, pendant presque trois ans, j'ai contribué à des travaux portant sur deux thématiques de recherche.
- La première concernait l'étude de l'impact d'une alimentation en silicium sur la défense de deux plantes modèles (arabidopsis et blé) face à un champignon pathogène (oïdium).
- La seconde concernait la caractérisation d'un champignon susceptible d'être utilisé en lute biologique.
Depuis mars 2009, je suis employé en tant qu'ingénieur de recherche à l'INRA de Jouy-en-Josas au sein d'une équipe s'intéressant aux bactéries probiotiques.
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Compétences
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Au cours de mes deux premières expériences professionnelles, j'ai pu acquérir et mettre en oeuvre des compétences techniques en:
- biologie moléculaire, comprenant notamment l'utilisation de la PCR quantitative et de puces à ADN (affymetrix et agilent)
- bioinformatique, avec de l'analyse de séquence et de données de puces avec R (packages Limma, Affy, principalement)
- immunologie (préparation d'anticorps, test ELISA)
- statistiques (utilisation de SAS)
- protéomique, avec initiation aux gels 2D
J'ai également encadré et/ou appuyé des étudiants:
- Un étudiant pendant la thèse
- Six étudiants pendant le post-doc
J'ai été le responsable de la plate-forme PCR quantitative pendant mon post doc:
- "import" de la technologie au laboratoire
- formation des étudiants et du personnel
J'ai eu l'opportunité de donner quelques heures d'enseignement à des niveaux divers
J'ai participé à la rédaction de plusieurs articles scientifiques publiés (7) ou en attente de décision (4) dans des revues à comité de lecture ainsi qu'à la rédaction d'un brevet
je sais utiliser les outils informatiques nécessaires à mon domaine (pack office, SAS (statistiques), divers outils bioinformatiques...)
Je parle anglais couramment
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Centres d'intérêt
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Comme le laisse entrevoir mon parcours, je me suis intéressé de manière générale à la santé des plantes.
Je m'intéresse énormément au développement des nouveaux outils d'analyse en génomique et protéomique et de leurs compagnons bioinformatiques. J'aimerais volontiers continuer à mettre en pratique mes capacités au profit d'analyses utilisant des outils de pointe tels que les biopuces. Ces outils ne sont bien évidemment pas réservés au domaine de la santé des plantes et je serai parfaitement enclin à changer de domaine d'activité.
Je suis actuellement en poste à l'INRA mais je reste en veille et examine toute offre permettant de continuer à effectuer un travail de recherche. Comme déjà mentionné, je suis tout à fait prêt à m'adapter à un nouvel univers de travail; que ce soit le domaine de recherche ou la structure d'accueil de nature publique ou privée.
2005 - 2008Au sein de ce laboratoire d'accueil pour mon post-doc, j'ai participé de près aux thématiques de recherche :
- Impact du silicium sur la stimulation des défenses des plantes (blé)
- Caractérisation d’un champignon utilisable comme agent de lutte biologique (concombre).
A fin de mener à bien les recherches entamées, j'ai :
- mis en oeuvre des techniques d'étude d’expression de gènes (puces à ADN et PCR quantitative) avec analyse bioinformatique ( R (packages limma, affy, affyplm,...) pour les puces et REST pour les données de PCR quantitative), d’analyse de séquences, de protéomique (gels 2D) et d'autres techniques de biologie moléculaire;
- travaillé en serres et chambres de croissance ;
- été responsable du poste PCR quantitative (import de la technologie au laboratoire, formation du personnel et des étudiants);
- développé des collaborations avec d’autres chercheurs;
- encadré et appuyé 6 étudiants (master et doctorat);
- donné quelques heures d’enseignement ;
- rédigé des articles scientifiques (6 articles rédigés et soumis dont 3 parus et 3 en attente de décision)
Encadrement : Richard Bélanger
2001 - 2005INRA (Insitut National de Recherche Agronomique)
Thèse portant sur l'évaluation de la durabilité de résistance d'un virus de plante (le virus de la jaunisse nanisante de l'orge) sur blé. L'objectif consistait à tenter de prévoir si de nouvelles variétés de blé résistantes à ce virus peuvent conserver cette propriété malgré le potentiel évolutif du virus.
Compétences et techniques mises en oeuvre :
Virologie, biologie moléculaire classique, séquençage, immunologie (tests ELISA), essais en champs et phytotron (chambres de croissance luminosité, hygrométrie et température contrôlées), manipulation d'insectes (pucerons), expérimentation sur l'évolution de virus
Encadrement: Emmanuel Jacquot, Maxime Trottet
Jury de thèse: Christophe Brugidou, Bruce McDonald, Jacques Le Gouis, Benoît Moury, Grégoire Thomas
2000 - 2001INPL : Institut national polytechnique de Lorainne
Impact de l'introduction d'une bactérie stimulant la croissance sur les communautés bactériennes indigènes
Compétences et techniques mises en oeuvre :
Microbiologie, Microscopie à fluorescence, réalisation de bactéries transformées à la GFP (green fluorescent protein), établissement de profils cataboliques et génétiques
2000 - 2000Surveiller les innovations et produits du marché de la sécurisation des réseaux informatiques par systèmes de cryptage/décryptage des données logiciels ou matériels
