Jacques-Aurelien Sergent

Consultance en nanotoxicologie et Informatique
Realisation d'études pour les industriels

Au sein de l'ISBS, je suis en charge en 2ème et 3ème année d'enseignements de Bioinfomatique moléculaire et cellulaire et de docking sous la supervision de B. Roudier, responsable de l'orientation Bioinformatique/Médicament de cette école.

Au sein du Service de Radiobiologie Expérimentale et d'Innovation Technologique et du Laboratoire de Cancérologie Expérimentale, le but de mon travail sera de développer une classification des nanoparticules en fonction de critères toxicologiques. Pour cela, une approche par transcriptomique sera réalisée.

Techniques utilisées :
culture cellulaire, transcriptomique, cytométrie de flux, microscopie electronique, tests de cytotoxicité et de génotoxicité, ...

Profil Recherche :
Mon travail portait, en continuité avec mon Ph D, sur l étude de la chloestase intrahépatique familiale progressive de type 1 par l'intermédiaire d'approches in silico et in vitro. Mon laboratoire GRP2H, dirigé par le Pr Nour-Eddine Lomri, est un laboratoire de Cergy-Pontoise rattaché à l UMRs 983 Centre de Recherche de St Antoine.

Biologie et Physiologie Cellulaire :
Culture cellulaire en condition d’adhésion ou en interface air-liquide, culture primaire
Culture et Transformation bactérienne, Transfection cellulaire,
Immunohistochimie, Immunofluorescence,
Dissection animale (souris et rat),
Microscopie visible/à fluorescence …
Electrophysiologie : Chambre de Ussing, Mesure d’efflux de molécules organiques (Spectrofluorimétrie et sonde ionique dédiée)

Biologie Moléculaire :
RT-PCR, PCR, siRNA, Extraction d’acides nucléiques (ADN/ARN), Southern blot,
Hybridation moléculaire et in Situ, mutagenèse dirigée, clonage …
Isolement d’ADN nucléaire ou mitochondrial,

Biochimie :
Purification de protéines,
Western blot,
Immunoprécipitation,

Informatique appliquée à la Biologie :
Annotation génomique, Annotation protéique, Alignements et phylogénie, Blast et ses dérivés, Pharmacocinétique, Modélisation tridimensionnelle de protéine, Docking moléculaire, Représentation de composés chimiques bi et tridimensionnel, Biostatistiques …

Informatique :
Programmation VBA (Visual Basic for Applications)
Programmation Web ( HTML, XML, SQL, CSS, SPIP, Xwiki)
Logiciels : Office, Access, Photoshop, MultiGauge, Logiciels Biologiques divers, ...

Profil Enseignement :
Création des 5 modules de Bio-informatique du L1 au M2
Création d un module d'Ethique Médicale en Master 1
Mise en place d'une plateforme d'enseignement à distance ( www.bio-info.fr )
Participation aux enseignements de M1 et M2 Biologie Cellulaire et Moléculaire (Biologie Moléculaire, Physiopathologies, TP Bio Mol)
Participation aux enseignements de méthodologies de Licence Professionnel Biotechnologies
Membre du Jury de soutenance de stage du M2 BCM (4 années)
Membre du Jury de diplôme BCM (4 années)
Organisateur du Colloque des Etudiants de Master Biologie Cellulaire et Moléculaire (2 années)
Encadrement de 6 stagiaires de Master 2 (stage de 6 mois), 2 stagiaires de licence professionnel Biotechnologies (stage de 4 mois) et 5 stages volontaires d'été de 3 mois (L3,M1)
Participation au recrutement des étudiants en Master Biologie Cellulaire et Moléculaire

Initiateur et Membre fondateur de la formation

Organisation des modules d'enseignement en Biologie et Bioinformatique
Animation du projet pluridisciplinaire annuel de la promotion d'étudiants
Création des modules d'introduction à la biologie, de pharmacocinétique et de docking moléculaire
Participation aux modules de génomique, protéomique et transcriptomique
Animation (2006-2008) du site web de la formation
Participation au recrutement des candidats