Joseph Cortes
Chef de Projet XML - Trusted Feed
Je m’appelle Joseph CORTES, marseillais, 29 ans. De retour en France après avoir vécu 2 ans à Dallas, Texas, USA.
Dès mes 18 ans, je suis allé sur Toulouse (Math Sup.Bio.), retourné à Marseille (BTS Biotechnologies), passé 4 années en région parisienne (IUP (Evry) et Master (Versailles) en Bioinformatique) puis sur Lyon (IPROB-ESSEP5) avant d’atterrir à Dallas, Texas, USA, de Mars 2006 à Décembre 2007.
De retour en France, un petit détour sur Sophia Antipolis avant de m'installer sur Aix-en-Provence.
Mon travail en tant que Chef de Projet XML - Trusted Feed consiste à :
- créer les campagnes Trusted Feed de mes clients (Priceminister, Keljob, Kelkoo...), d'être à leur écoute, de les rassurer et de les accompagner tout au long de la leur campagne,
- travailler avec les fournisseurs (Yahoo! et Orange),
- développer l'aspect technique du Trusted Feed afin d'accélérer la réalisation des campagnes.
Mon travail aux Etats Unis consistait à être à l'écoute des chercheurs, de leur besoin et attentes, de les traduire en requêtes informatique puis de réaliser des outils informatiques, ou de donner des directives à une équipe d'informaticiens, afin de les aider dans leurs analyses.
Travailler à l'étranger ne me dérange donc pas tant qu’il s’agit d’y trouver un quelconque épanouissement professionnel ET personnel.
19 contacts2006 - 200815 mois au sein de l’équipe microarray pour la création d’outils informatique dédiés aux chercheurs :
-Développer des outils pour aider l’analyse des données issues du scan des puces à ADN: analyse du besoin et élaboration du cahier des charges non formalisés, codage (JAVA, JSP, Spring, javascript, Ajax, CSS, MySQL et Tomcat) et test
-Elaboration de la documentation : manuel utilisateur, manuel d’installation et démonstration
-Intégrer les datasets immunologique publique et ceux générés au sein de l’institut, dans une database interne
-Créer des portails Internet permettant la capture, l’organisation et la pré-analyse d’informations cliniques des échantillons envoyés au laboratoire pour y être analysés : analyse du besoin et élaboration du cahier des charges non formalisés, codage (JAVA avec POI pour création de fichiers de sortie en Excel) et test.
6 mois au sein de l’équipe microarray pour la biologie moléculaire et puce à ADN : Obtenir l’ARN d’échantillons sanguins, les déposer sur puce et les scanner.
Contexte informatique :
Une fois les données des puces à ADN obtenues, des étapes de normalisations et de filtrages (enlever le bruit de fond de lame des intensités des spots d’ADN) sont réalisées. Ensuite le laboratoire a eu besoin de trier et identifier les gènes dont l’expression est statisquement différent par rapport à un groupe témoin. Il m’a donc été donné de concevoir un programme en Java qui permettait d’effectuer ces tâches et de donner les résultats sous forme de pages Excel.
Avec le nombre grandissant de collaboration avec des études clinique, on m’a confié la réalisation de bases de données et formulaires internet, utilisable par les cliniciens depuis leur lieu de travail, et ce à travers 3 différents pays, afin d’initier l’envoi des échantillons sanguins, leur analyse, leur interprétation biologique avec études statistique s’appuyant sur les données clinique capturées.
2005 - 2005Réalisation d'un programme informatique permettant le filtrage dynamique des données issues des puces CGH, produites au sein même de l’entreprise :
- analyse du besoin et élaboration du cahier des charges non formalisés, codage (JAVA) et test
- Elaboration de la documentation : manuel utilisateur.
Contexte informatique :
Le chercheur pour qui je travaillais avait besoin de pouvoir « jouer » avec les données de puce à ADN de l’entreprise via des jeux de filtre. Le but étant, à partir de même échantillons analysés dans différents laboratoires, de pouvoir comparer les résultats entre eux et d’arriver à la même conclusion biologique ; ou encore de pouvoir soutirer le plus d’information viable de puces ayant un des intensités de spots trop proche de celle de la lame, et donc enlevé de l’analyse par filtration avec le bruit de fond.
Pour plus d’information, veuillez mon rapport de stage intitulé "Analyse des aberrations chromosomiques : Filtrage et transformation interactifs des données de puces à ADN" via ce lien : http://bioinfo.webmarketing.free.fr/documents/j...
