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Julian NOMMÉ

TOULOUSE CEDEX 4

En résumé

I have always been interested in protein structure/activity relationship and drug design.

During my PhD, I developed strong skills in 3D structures manipulation. I worked on the in silico design and optimization of peptidic inhibitors (anticancer drugs) of the human Rad51 protein polymerization (a protein involved in DNA repair). I used Molecular Modeling calculations as a predictive and selective tool to back up biochemical and in vitro activity tests (Fluorescence spectroscopies). I also performed in cellulo tests to confirm inhibitors' action into cancerous cells. I am thus used to analyze 3D structures and to deal with protein/protein and protein/ligands interactions.

In 2010 I joined Pr. Lavie’s group at the University of Illinois at Chicago. I have there acquired strong skills in molecular biology, protein expression/purification/crystallization and in X-ray structure determination. I worked on different projects not only including transmembrane and scaffold proteins but also enzymes. Basically, I worked at understanding at the molecular level the function and workings of medicinally relevant enzymes and proteins in order to improve and develop novel therapeutics. We addressed questions such as those that relate to substrate (or drug) specificity, enzymatic mechanisms, and the determinants of protein-protein recognition and regulation.

In 2014 I moved back to France and joined Dr. Mourey’s group at the Institute of Pharmacology and Structural Biology in Toulouse. I was awarded a 2-year postdoctoral fellowship from ARC Foundation to develop my project aiming at better understanding microtubules and developing new anticancer drugs.

In 2017, I joined the Laboratory of Biological Systems and Chemical Engineering (EAD1 team) in Toulouse where I used my skills in structural biology and biophysics to characterize and improve proteins’ catalytic properties regarding to PET and PLA plastics degradation in order to rethink lifecycle of Plastics.

Mes compétences :
Biology
Drug Design
Molecular biology
X-Ray Crystallography
Chromatography
Data Collection
Enzymes
In Vitro Studies
In Vivo Studies
Investigation team coordination
Molecular Modelling
Peptides
Project Management
Proteins
Scientific Research
Synchrotron
Teamwork
Linux
Microsoft Windows
UNIX
Fast learning of new technologies
Developpement of new therapeutic molecules
Circular Dichroism
Fluorescence spectroscopies
Grant & publication writing
Protein expression and purification
Isothermal titration calorimetry
Differential Scanning Fluorimetry
Biochemisitry

Entreprises

  • Laboratoire D'ingénierie Des Systèmes Biologiques Et Des Procédés - Lisbp - Research Scientist

    TOULOUSE CEDEX 4 2017 - 2018 Biochemistry; X-Ray crystallography
  • IPBS - Research scientist, Biochemistry

    2015 - 2017 Postdoctoral fellow, Biochemistry and X-ray crystallography at IPBS UMR5089 CNRS, fellowship from ARC association
  • ITAV - Postdoctoral fellow, Biochemistry

    2014 - 2015 Postdoctoral fellow, Biochemistry and X-ray crystallography at ITAV USR3505 CNRS and IPBS UMR5089
  • University of Illinois at Chicago - Postdoctoral research associate scientist

    2010 - 2014 Biochemistry; X-ray crystalography
  • CNRS UMR 6204 - Ingénieur Recherche

    2009 - 2009 Emploie des techniques de modélisation et dynamique moléculaire pour la conception de molécules inhibitrices d'interactions protéiques.
  • CNRS UMR 6204 - Doctorant

    2006 - 2009 Mon travail de thèse a consisté à concevoir des inhibiteurs peptidiques de l'activité d'une protéine de réparation de l'ADN.
    La conception de ces inhibiteurs avait pour but de développer des médicaments afin d'apporter un soutien aux traitements anti-cancéreux.

    Poue cela, j'ai pu utiliser la Modélisation Moléculaire comme technique de prédiction et de sélection dans l'élaboration de ces inhibiteurs avant de les tester in vitro.
    Pour réaliser ces tests in vitro, j'ai principalement utilisé des outils de spectroscopie optique tels que la fluorescence, le dichroïsme circulaire et encore l'anisotropie de fluorescence.

    Suite à l'élaboration des inhibiteurs et des tests in vitro, j'ai réalisé des cultures de cellules cancéreuses afin de confirmer l'efficacité de ces peptides dans un environnement biologique.

    En résumé, lors de mon doctorat, j'ai pu acquérir des compétences en :

    - Modélisation Moléculaire pour analyser les interactions protéine/protéine et protéine/ligand et construire des modèles moléculaires

    - Spéctroscopie Optique comme le dichroïsme circulaire, l'anisotropie de fluorescence et l'HPLC pour suivre les interactions protéine/protéine et protéine/ligand et valider les modèles élaborés par modélisation

    - Culture cellulaire

    - Synthèse de peptides en phase solide


    En parallèle, j'ai eu l'occasion de faire de l'enseignement.

    Ces cours allant de la Licence 1 au Master 2 portaient sur la biochimie générale, les techniques de fluorescence et la microbiologie.

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