Issy-les-Moulineaux
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Après une formation généraliste à but professionnalisant (Master pro) en Biologie moléculaire, je me suis orientée par le biais de mes stages vers le domaine de la biologie marine et de la microbiologie.
Compétences pratiques :
* Biologie moléculaire et instrumentation:
- ADN : extractions plus ou moins complexes, PCR, PCR en temps réel, PCR nichée, électrophorèse.
- ARN totaux : extractions des et synthèse des ADNc par RT-PCR.
- Macroarray : hybridation moléculaire et radioactive.
- Miniarrays : mise au point, conception des membranes et validation de la technique par hybridation colorimétrique.
- Banque de clones : purification ADN, ligation, transformation et clonage ; extraction plasmidique et digestion enzymatique.
- Banque de fosmides.
- RFMCA (Analyses des courbes de fusion des fragments de restriction en temps réel – PCR en temps réel).
- D-HPLC (Chromatographie liquide à haute pression en condition dénaturante) : travaux complémentaires à la RFMCA ; mise au point d’un référentiel archéen (méthanogènes) et traitement des données.
- DGGE (gel d’électrophorèse en condition dénaturante), mise au point et utilisation de la technique pour la détection de bactéries marines pathogènes ou non.
- Q-PCR : mise au point de courbes étalons bactéries et archées, en vue de travaux ultérieurs sur des gènes de fonction.
- SIP (stable isotope probing), mise au point de la technique du permettant la discrimination et l’identification de groupes fonctionnels d’organismes spécifiques incorporant des substrats particuliers (marquage froid). Utilisation d’ultracentrifugeuse.
- FISH : conditionnement des échantillons, inclusion en résine, coupe et hybridation in situ.
- FISH-TSA : Hybridation In situ par fluorescence avec une amplification de signal de la tyramide
- RFLP : discrimination de profils de clones.
- Cytométrie en flux : comptage cellulaire, analyse et tri de cellules.
- Robot de pipetage et distribution Hamilton.
* Microbiologie :
- Cultures : bactéries et archées, aérobies et anaérobie.
- Observation microscopique (FISH), ApoTome.
- Isolement de souches microbiennes en GMD (Gel MicroDroplet) avant enrichissement via la plateforme à haut débit.
* Biologie :
- Architecture racinaire.
- Dissection de crevettes.
* Analyse informatique et bio-informatique:
- Analyse des résultats obtenus en macroarrays.
- Analyse et interprétation des miniarrays : choix et dessins des amorces spécifiques des gènes « sondes ».
- Traitement bio-informatique des séquences.
- Analyses phylogénétiques préliminaires.
- Analyse des gels DGGE.
- Design de sondes TaqMan et amorces
* Types échantillons :
- Le modèle végétal Arabidopsis thaliana.
- Le genre Synechococcus.
- Les Gorgones Paramuricea clavata et les bactéries marines associées.
- Les lacs de saumures (eaux de bassins profonds hypersalins) et sédiments marins profonds.
- Les bactéries et archées de la souchotèque de l’Université de Bretagne Occidentale.
- La crevette hydrothermale Rimicaris exoculata.
- Picocyanobactéries (Crocosphera watsonii, Cyanothece sp.)
Mes compétences :
Biologie Moléculaire
Biologie marine
Microbiologie
