Marine Herbert

Mission: "Détection de contaminants (bactéries, levures, moisissures, virus) dans des lignées cellulaires et souches bactériennes, à l'aide des outils de la biologie moléculaire, de microbiologie et de virologie".

- recherche bibliographique, nouvelles technologies, des produits existants et/ou concurrents, études des réglementations associées.
- Conception d’amorces pour une PCR, utilisation de NetPrimer, Primer 3, Blast.
- travail en laboratoire : amplification de bactériophages, culture de cellules CHO, extraction d’acides nucléiques, PCR, RT-PCR, Q-PCR, comparaison de kit de purification (utilisation de polymères cationiques, de filtres, et de billes magnétiques).

Stage volontaire de master 1: durée 4 mois et demi de la mi-avril jusqu'à août inclus.
Sujet de stage: "Cartographie génétique de facteurs de résistance à la rouille dans un plan de croisement factoriels de peupliers".
- collecte d'informations et constitution d'une bibliographie (utilisation du logiciel EndNote).
- travail au laboratoire de biologie moléculaire, mise à jour de son cahier de laboratoire, PCR-M13 fluorescente, puis passage des échantillons sur séquenceur.
- visualisation et traitement des résultats à partir du logiciel GeneMapper.
- outils statistiques
- venant de mon initiative il a eu rédaction d'un rapport exclusif pour l'Inra.

Cartographie de mutants accumulateurs de magnésium:
- extraction d'ADN, PCR, migration des échantillons dans gels d'agarose
- utilisation indirecte de la technique DNA-microarray
- culture d'Arabidopsis thaliana en hydroponie et in vitro

Recherche de l'agent pathogène de la Fièvre Q par des technique de biologie moléculaire.
- PCR, Real-Time PCR, transformation bactérienne et clonage.