Matthieu L.
Stagiaire/Chargé de recherche en Bioinformatique, Cepheid Europe
Passionné par les sciences, l’étude du vivant et par bien d’autres domaines, c’est tout naturellement que j’ai orienté mes études dans les domaines de la Biochimie et des Biotechnologies, afin de me spécialiser par la suite dans le domaine de la Bioinformatique.
Mes capacités d’adaptation, ma motivation, mon enthousiasme et ma soif d’apprendre et d’acquérir de nouvelles compétences sont, selon moi, parfaitement adaptées à ce domaine qu’est la Bioinformatique qui allie des disciplines en constante évolution.
L’oncologie et l’étude de maladies telles que le SIDA ainsi que de leurs causes sont des domaines qui m’intéressent tout particulièrement, et c’est cet intérêt qui m’a conduit à porter mon attention sur les microARNs et leurs propriétés.
Je me ferai un plaisir de répondre à toute question me concernant, au sujet de mon cursus ou même à propos d’une éventuelle perspective suite à la fin de mon année de Master 2 de Bioinformatique (entre la fin du mois de Juin et le début du mois de Juillet 2012, mon stage de fin d’études se terminant, lui, à la fin du mois d’Août 2012).
Compétences
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Langues :
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• Anglais: lu, parlé, écrit (termes techniques, publications scientifiques)
• Espagnol: niveau scolaire
(• Etude du latin pendant 6 ans)
Biologie :
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• Biologie moléculaire : techniques PCR,
RT-qPCR, électrophorèse, extraction d’ADN et d’ARN, synthèse de cDNA, …
• Parasitologie : identification de parasites humains, étude de leurs cycles de développement.
• Microbiologie : ensemencements et isolements, analyse d'aliments, coprocultures, identifications de germe (ex : S. aureus, E. coli, …)
• Culture cellulaire : culture de fibroblastes, caractérisation d'une lignée transformée, manipulation sous PSM de type II, …
• Métrologie : test de balances, de micropipettes : bases
• Titulaire de l'Habilitation à l'expérimentation animale de niveau II
Informatique :
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• Programmation : Java (Eclipse), Python (Scite), Perl (exécutable standalone, interfaces graphiques en Tk et Gtk2), C, bases en Matlab et initiation à Visual Basic (Open Office)
• Logiciels de Statistiques : R, initiation XLSTAT
• Data Mining : programmation d'un classificateur bayésien naïf, d'un script de validation croisée (Perl) et projet de développement d'une méthode de Priorisation de gènes d'intérêt reposant sur des matrices de distance (Perl, R)
• Internet : HTML, PHP, CSS, initiation XML
• Logiciels de retouche d'image : Adobe Photoshop
• Construction de base de données : PostgreSQL,
pgAdmin III
• Linux : utilisation courante, initiation programmation shell
• Modélisation moléculaire : Chem3D, UCSF Chimera, ViewerLite, programmation d'une application standalone d'analyse de séries temporelles avec interfaces graphiques (Perl, Tk, Gtk2)
• Logiciels de bureautique : Word, Excel, PowerPoint, (Access, Open Office)
2012 - 2012Développement d'un outil de priorisation de cibles mRNAs de microRNAs humains d'intérêt basé sur des méthodes existantes de prédiction et avec interface HTML/PHP/...
2009 - 2010Création d'une base de données de résultats RT-qPCR.
Programmation en langage Java d'une application de recherches d'informations sur les microRNAs.
2008 - 2009Stage de 3 mois au Québec, CANADA.
Sélection de mutants d'Actinobacillus pleuropneumoniae, pathogène du porc, incapables de former du biofilm.
Microbiologie : étalements, cultures de bactéries, etc.
Biologie moléculaire
2007 - 2008Stage d'observation du fonctionnement de ce type de structure.