Mes compétences :
Microbiologie
Biologie moléculaire
Génétique
Analyse de données de séquençage
Entreprises
Université Pierre et marie Curie Paris 6
- Enseignante
2010 - 2012Encadrement de TP de génétique et de biologie cellulaire en licence de biologie.
TD de soutien en biologie cellulaire et moléculaire
Laboratoire Pierre Aigrain, ENS Paris
- Chercheuse doctorante
2009 - 2012Sujet de la thèse: Expériences d'évolution de bactéries avec brassage de génome.
J'ai réalisé des expériences d'évolution de bactéries dans des réacteurs afin de déterminer l'effet des échanges d'ADN entre individus de même espèce. Le brassage de génomes a été réalisé par extraction de l'ADN génomique de la population qui a ensuite été réinjecté aux bactéries qui peuvent intégrer cet ADN par transformation naturelle. L'évolution de la population a été suivie par séquençage de génomes de populations et de clones isolés.
Au cours de ma thèse, j'ai du principalement rechercher les conditions nécessaires pour avoir un taux de transformation acceptable dans nos expériences d'évolution, extraire et purifier de l'ADN génomique, améliorer le montage expérimental confectionné par le laboratoire, analyser des séquençages de génomes haut débit de populations et de clones. J'ai aussi réalisé des modifications génétiques de souches bactériennes en construisant des cassettes permettant de supprimer des gènes.
Compétences: extraction et purification d'ADN, PCR, design d'amorces de PCR et de cassette, culture bactérienne, transformation bactérienne, analyse de séquences, analyse de résultats de séquençages de génomes, Samtools, Bowtie, Mosaik, Velvet, BLAST, Linux, NCBI.
Hôpital Pitié Salpétrière, centre de recherche de l'institut du cerveau et de la moëlle épinière
- Ingénieur de recherche en génétique
2009 - 2009Sujet de recherche: Clonage positionnel d'un nouveau locus de paraplégie spastique.
Analyse de liaison génétique à l'aide de marqueurs microsatellite afin de trouver de nouvelles familles liées à ce nouveau locus et de réduire l'intervalle de liaison et le nombre de gènes candidats.
Séquençage de gènes candidats.
Compétences: mise au point de PCR, design d'amorces de PCR / séquençage, purifications de PCR, séquençage de gènes, génotypage de marqueurs microsatellite, analyse de liaison génétique, Seqscape.
Faculté de médecine de l'Hôpital Necker, INSERM U845
- Assistante de recherche
2008 - 2008Clonage de l'ADNc de cPLA2 dans les plasmides pDsRed C1 et N1 dans le cadre de l'étude de l'interaction de cPLA2 avec CFTR.
Compétences : PCR, RT-PCR, digestion enzymatique, ligation, clonage, mutagénèse dirigée, transformation bactérienne, préparation de plasmides, purification d'ADN, électrophorèse, purification sur gel
