Nicolas Lebreton
Informaticien, société E2i (www.eii.fr)
Langages : Perl, Python, Java, OWL, SQL, LWP, COBOL
Logiciels :
- PHP Myadmin (SGBD: Système de Gestion de Base de Données)
- Clustal, BLAST, Bioedit (analyse de séquences génétiques)
- Protégé (logiciel éditeur d'ontologies)
- Mascot, Profound, Prospector (spectrométrie de masse)
- SAS, R (statistiques)
- SwissPdbViewer, VMD (modélisation structure 3D protéines)
- Bioanalyseur pour puces à ADN
- Latex, OpenOffice, MicrosoftOffice
Biologie :
- Physiologie végétale et animale (dissection, coupe transversale)
- Immunologie (test ELISA, hybridation in toto)
- Génétique (électrophorèse, PCR, Northern et Western blot)
- Initiation à la prévention des risques professionnels (risques biologiques, radioactivité)
26 contactsActivité focalisée sur les systèmes d'information (services web, interfaces et bases de données)
Réalisation d’ontologies de tâches et de domaine en bioinformatique et utilisation de la sémantique pour l’appariement semi-automatique de services Web
Bioinformaticien, INSERM U522, Régulations des équilibres fonctionnels du foie normal et pathologique
2007 - 2007Création d’une ontologie en OWL pour modéliser le métabolisme du foie et sa circulation afin de raisonner sur ce réseau métabolique
2006 - 2006Récupération des séquences flanquantes biologiques des points d’intégration de rétrovirus (programmation en Perl et LWP).
Recherche de l’influence des régions d’attachement à la matrice (MAR) sur les positions d’intégrations de ces rétrovirus.