Menu

Romain DUMOULIN

LYON

En résumé

Mes compétences :
Biologie moléculaire
Microbiologie
Génétique bactérienne

Entreprises

  • Altran France - Consultant Ingénieur

    LYON 2019 - maintenant
  • Sogeti - Consultant IT

    Issy-les-Moulineaux 2017 - 2019 Mission aux Hospices Civils de Lyon (HCL).

    Industrialisation, exploitation, expertise technique sur le dossier patient informatisé Easily au sein des HCL et de ses clients.

    Industrialisation :
    - Scripting Powershell
    - Scripting Transact SQL

    Exploitation :
    - Gestion des bases de données SQL Server
    - Administration des outils Microsoft (AD, DNS, IIS, ...)
    - Environnement VMware vSphere 5.5 et de l’environnement HYPER-V 2012 et 2016
    - Outils NAGIOS V3, MICROSOFT SC2012
    - Administration Windows Server 2003, 2008 et 2012 en cluster

    Coordination :
    - Gestion de projet
    - Maintien des documentations
    - Formation aux outils
    - Infogérance des clients

    Rigueur, méthodologie, adaptation, proactivité, réactivité, travail en équipe.
  • Université Clermont 2 Blaise Pascal - Chercheur Postdoctoral

    Clermont-Ferrand 2015 - 2017 Dans le domaine des polyols chiraux et de la chimie des glucides, les problèmes inhérents à la régiosélectivité, stéréosélectivité chimiosélectivité sont un défi pour les chimistes, obligeant à appliquer des stratégies sophistiquées de protection alors qu'à l'inverse, la biocatalyse rend les groupes protecteurs inutiles. Ainsi dans de nombreux cas, l’utilisation d’enzymes permet de réduire le nombre d'étapes et de réaliser les réactions dans des conditions douces.
    Ce projet concerne, la transcétolase (TK), appartenant à la famille des enzymes à thiamine pyrophosphate. La TK catalyse la formation d’une liaison C-C conduisant en une seule étape à des polyols chiraux, D-thréo cétoses (3S, 4R). La TK est hautement spécifique du substrat donneur de type cétol, stéréospécifique et énantiosélective.
    L'objectif de ce projet est de développer de nouvelles TK optimisées pour de nouvelles applications synthétiques dans quatre directions :
    (i) modification de la stéréosélectivité
    (Ii) modification de la spécificité vis-à-vis du donneur
    (Iii) modification de la spécificité vis-à-vis de l’accepteur
    (Iv) développement de nouvelles réactions enzymatiques en cascade pour la synthèse de nouveaux produits chiraux.
  • ANSES - Post-doctorat

    Maisons-Alfort 2013 - 2014 L’objectif du projet est de caractériser, sur le plan des fonds génétiques (MLST et groupes phylogénétiques), des pathotypes (EHEC/STEC/EPEC et facteurs de virulence) et de la production de BLSE (gènes, plasmides), des populations d’E. coli d’origine bovine issus d’animaux sains (portage) et d’animaux malades (diarrhées néo-natales). Il vise à identifier, à la fois dans un contexte de portage et dans un contexte infectieux, si la distribution de certains déterminants de résistance et/ou de virulence d’importance majeure en santé publique se superpose, ou non, à la distribution de clones dominants (et lesquels) d’E. coli chez les bovins, et de comparer ces résultats aux données connues chez l’homme. Il vise aussi à documenter l’hypothèse d’une augmentation du pourcentage de souches de type EHEC, par ailleurs très prévalentes chez les bovins, produisant simultanément des BLSE, à l’image du clone d’E. coli CTX-M-15/O104:H4 récemment décrit. Ce projet propose ainsi l’étude approfondie des relations entre fonds génétiques et déterminants de résistance et/ou virulence de certains clones, ainsi que des mécanismes pouvant présider au maintien ou à l’acquisition de déterminants génétiques de virulence et/ou de résistance dans des fonds génétiques spécifiques. La connaissance de ces populations d’E. coli contribuera in fine à une meilleure appréciation du risque réel de diffusion de clones hautement résistants et/ou virulents, ou de structures génétiques mobiles (plasmides en particulier), entre l’animal et l’homme, et réciproquement.
  • INRA - Doctorant

    Paris 2008 - 2012 Etude de l’expression d’elrA chez la bactérie lactique Enterococcus faecalis et du rôle de sa protéine dans la pathogénie opportuniste

    Ce travail a permis, par des approches de génétique bactérienne et de biologie moléculaire, de déterminer le rôle d'un régulateur transcriptionnel de la famille des Rgg (Regulator gene of glycosyltransferase) sur l’expression de l’opéron elrA (enterococcal leucine rich protein A). En parallèle, des approches de biologie cellulaire et de péritonite chez la souris ont mis en évidence le rôle de l'opéron elrA dans l’échappement à la phagocytose et la virulence.
  • CNRS - Stage de Master 2

    Paris 2008 - 2008 Etude du locus dgkA/plsB impliqué dans la voie de biosynthèse des phospholipides chez Escherichia coli.

    Ce travail a permis, par des approches de génétique bactérienne et de biochimie des protéines, de confirmer les rôles de RpoE et de la réponse stringente sur l'expression des gènes dgkA et plsB.
    Ce travail a aboutit par la publication d'un article dans la revue Molecular Microbiology (Wahl et al. 2011)
  • CNRS - Stage de Master 1

    Paris 2007 - 2007 Etude de l’interaction entre les protéines Rel et les 2 Acyl Carrier Proteins de Streptococcus pneumoniae par double hybride bactérien.

Formations

  • AgroParisTech (Paris)

    Paris 2008 - 2012 Doctorat
  • Université Aix Marseille 2 Mediterranée

    Luminy 2006 - 2008 Master

    MBVB (Microbiologie, Biologie Végétale et Biotechnologie)
  • Université Du Sud Toulon-Var (La Garde)

    La Garde 2003 - 2006 Licence

    Science de la vie (Option Microbiologie)

Réseau

Annuaire des membres :