Sophie Perillous

-Ingénieur développement d'essais (Mission de 10 mois):
Production et purification de protéines recombinantes
Etudes d'interactions protéines-protéines par la technique HTRF
Transfert et optimisation d'essais enzymatiques
Criblage de molécule chimique à grande échelle
Programmation et utilisation de robots

-Ingénieur de recherche (Mission de 10 mois dont 6 mois en tant que stagiaire): Caractérisation biochimique et cellulaire d'inhibiteurs d'une enzyme de déubiquitination
Pharmacologie in vitro: détermination d'EC50
étude de la spécificité et réversibilité

Pharmacologie cellulaire: traitement de lignées cellulaires
évaluation sur la viabilité cellulaire
évaluation sur les substrats enzymatiques (Western-Blot)

Stage d'une durée de 6 mois:
Etude de l'implication des mucines dans la carcinogenèse pancréatique:
- extraction d'acides nucléiques
- clonage de shRNA
- PCR/RT-PCR
- Culture de cellules eucaryotes
- Transfection de siRNA

Stage de 3 mois:
Génotypage de SNP à grande échelle : SNPlex Genotyping System (Applied Biosystems).
Analyse des données avec l'application GeneMapper.

Résultats publiés: Genome-wide prediction of functional gene-gene interactions inferred from patterns of genetic differentiation in mice and men. PLoS ONE-2008.

Stage d'une durée de 2,5 mois:
Développement de marqueurs PCR par analyse bioinformatique:
- Recherche dans les banques de données
- Alignement de séquences par l'algorythme BLAST
- Design d'amorces testées ensuite par PCR