Virginie UBERTELLI
Responsable développement biopuce, Serial Genetics
COMPETENCES
Biopuce à ADN
·Fabrication de biopuce en verre ou plastique : spotter MicrogridII de Biorobotics, GMS 417 Arrayer
·Hybridation sur paillasse ou automate (Lucidea SlidePro d’Amersham, Hyblive de Genewave)
·Lecture de biopuces : scanner Axon 4000B, CheckScanner de Ditabis, ScanArray
·Analyse d’image : GenepixPro, Imagene 4.1, logiciel interne
·Exploitation des résultats
·CGH array
Biologie moléculaire
·Maîtrise de la PCR singleplex et multiplex, et des méthodes d’amplification isothermale (Genomiphi)
·RT-PCR, PCR en temps réel
·Marquage de produits de PCR ou ADNc (fluorophore, biotine)
·Extraction et purification d’ADN, ARN et plasmide
·Hybridation in-situ
·Quantification ADN, ARN : Bioanalyser Agilent, spectrophotomètre, nanodrop
Biochimie
·Extraction protéique
·SDS-PAGE et coloration au bleu de Coomassie
·électrophorèse 2D ou en gel d’agarose
·western blot, northern Blot
·production d’enzyme à partir de plants de tabac agro-infiltrés
Autres
·Rédaction de planning, plan de travail et protocoles
·Tenue à jour du cahier de laboratoire
·Rédaction de fiches d’instructions, de rapports d’activité
·Construction de dossiers de conception pour la commercialisation de kits de diagnostic et autres
·Gestion de fournisseurs, commandes, stocks et inventaire
·Suivi du bon fonctionnement des équipements
·Encadrement de personnel et stagiaires
·Réalisation de formations ou démonstration pour des clients ou partenaires
Assurance Qualité
·Aide à la mise en place d’un système d’assurance qualité en vue d’un marquage CE de kit de diagnostics selon la norme ISO 13485 et la directive 98/79 CE
·Participation au Comité d’assurance qualité
Bioinformatique
·Collecte de données de séquences, Snp, publications…(NCBI, SNpper, UCSC, SRS, dbSNP, EXLRdb)
·Comparaison et alignement de séquences : BLAST, ClustalW, Dialign, BioEdit
·Dessin et choix d’amorces : Primer3, FastPCR, NetPrimer, MFold, GenomeTester…
·Dessin de sondes HairLoop (équivalent Molecular Beacons) et sondes linéaires
·Annotation et prédiction de séquences
Informatique: Word, Excel, Power Point, StatEl, MedCalc
Langue: Anglais lu et écrit
22 contacts2004 - 2010Responsable du Développement des trousses de diagnostic sur Biopuce
Technicienne Supérieure de Laboratoire
Mission :
Développer des kits de diagnostics moléculaires médicaux et industriels sous assurance qualité (ISO 13485) permettant l’analyse de mutations, délétions/insertions et duplication, en vue d’un marquage CE-DIV.
Former et encadrer une équipe de 2 techniciens R&D et stagiaires, en coordination avec l’équipe de certification et production.
Participer à la mise en place du Laboratoire de R&D.
Réalisation :
Pharmacogénétique :
·Conception du kit « AVK », en cours de marquage CE, permettant l’analyse de 3 marqueurs impliqués dans la sensibilité des patients aux traitements par anti-coagulant oraux (Previscan)
Maladies héréditaires :
·Développement d’une trousse permettant la détection de 3 mutations pour le diagnostic de l’Hémochromatose
·Conception du kit « CF49 » marqué CE permettant l’analyse de 49 mutations impliquées dans la Mucoviscidose
·Mise au point d’un prototype de biopuce pour la détection de mutations de la maladie de Charcot-Marie-Tooth
Tests Industriels :
·Mise au point d’un prototype de biopuce, en collaboration avec l’Institut de Recherche sur la Biologie de l’Insecte, pour la spéciation de 10 espèces de termites
·Développement d’un prototype de test pour Sanofi-Aventis
2002 - 2003Stage 15 semaines
Etude de l’expression des protéines au cours du développement et de la régulation post-transcriptionnelle chez la drosophile
