Christine Hoogland

Christine Hoogland

Clinical database developer, NovImmune
 

En poste chez FIND

Précédents : FIND, NovImmune, Queensland Institute of Medical Research, Université de Genève, Institut Suisse de Bioinformatique, Université Claude Bernard-LYON1, Villeurbanne (69)

 

Précédents : Clinact Formation, Université Lyon I - Claude Bernard, Université Paris 11 Paris Sud

 

    En résumé

    Bioinformaticienne / Développeur scientifique / Data manager 20 ans d'expérience couvrant tous les aspects de la conception et du développement d'applications scientifiques (spécification, design, implémentation, test, surveillance, support utilisateur), avec une forte composante programmation, développement web (back-end et front-end) et data management (database programming et analyse de données). Autodidacte et pragmatique, appréciant de pouvoir évoluer et développer ses connaissances au gré des projets. A la recherche d'un environnement de travail varié et stimulant, alliant collaborations et services. • Langage de programmation : Perl, PHP, SAS, shell, Java, R/Bioconductor. • Gestion de données : Oracle, PostgreSQL, MySQL, SQLite, SAS. • EDC : SAS/FSP, Capture system, Clinfile, REDCap, Viedoc, OpenSpecimen, OpenCLinica. • Développement Web : LAMP/XAMP, perl CGI, PHP, HTML, javascript, jQuery, CSS, JSON, XML, CMS (Mambo/Joomla), REST. • Media sociaux: Wiki (MediaWiki, PmWiki, Confluence), Blog (WordPress), Twitter, LinkedIn. • Outils de développement : SVN, PBS, NetBeans, Toad, R Studio. Profile in English: http://ch.linkedin.com/pub/christine-hoogland/23/778/333 Liste de publications: http://scholar.google.com/citations?user=vzuhIW0AAAAJ&hl=en

Parcours

Clinical Data Scientist

Chez FIND

De janvier 2020 à aujourd'hui
- Gestion des données cliniques: revue et implémentation des eCRFs, support SDV, gestion des requêtes, création de rapports, etc. - Support bioinformatique à la gestion et l'analyse de données tNGS pour le diagnostic des résistances aux médicaments antituberculeux.
 

Biobanking Data Scientist

Chez FIND

De mai 2019 à décembre 2019
- Responsable de la Biobanque clinique: gestion, caractérisation et suivi des échantillons collectés, interaction avec les équipes cliniques et les partenaires de l’entrepôt, sélection des échantillons demandés, intégration des données clinique et échantillons, création de rapports, etc.
 

Clinical database developer

Chez NovImmune

De octobre 2016 à avril 2019
- Mise en place, validation et suivi des bases de données cliniques, programmation et validation des contrôles de cohérence, émission des requêtes et intégration des réponses, création de rapports, documentation technique (DMP, DVP, SOP), conception/annotation de CRF, import/export/réconciliation de ...
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Clinact Formation, Sevres

Clinical Data Manager, Clinact Formation

De avril 2016 à juin 2016
Mise en œuvre des différents aspects de la gestion des données des études cliniques de l'élaboration des CRFs (papier ou électronique) au gel de la base, mise en place et validation de la base de données, programmation et validation des contrôles de cohérence, émission et intégration des requêtes, ...
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Senior research officer

Chez Queensland Institute of Medical Research

De juillet 2012 à juin 2015
Pipelines pour l'analyse de données protéomiques (identification et caractérisation de modifications post-traductionnelles, protéogénomique, PROTOMAP), typiquement conversion de fichiers, extraction, filtrage et nettoyage de données, intégration et visualisation, soumission de jobs sur cluster de ...
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Collaborateur scientifique

Chez Université de Genève

De février 2009 à mars 2011
Développement (en équipe, partage du code) d’applications bioinformatiques (web et locales) pour la protéomique : conversion de données, automatisation de pipeline, analyse et gestion de données expérimentales, interface graphique, etc. incluant spécifications selon les besoins utilisateurs, ...
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Responsable de recherche

Chez Institut Suisse de Bioinformatique

De janvier 1997 à septembre 2010
• Responsable de plusieurs serveurs web scientifiques (www.expasy.org, www.expasy.org/ch2d/, world-2dpage.expasy.org/repository/, miapegeldb.expasy.org, www.swissproteomicsociety.org, www.eupa.org,…), avec/sans base de données : configuration, administration, design, implémentation, développement, ...
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Doctorant

Chez Université Claude Bernard-LYON1, Villeurbanne (69)

De 1993 à 1996
• Développement d’une base de connaissances sur la localisation chromosomique des éléments transposables chez la drosophile, implémentation de tests statistiques dédiés. • Publications scientifiques dans revues internationales, présentations orales à des conférences nationales et ...
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Compétences

 
  • Bases de données
  • Bio-informatique
  • Bioinformatique
  • HTML
  • Internet
  • JAVA
  • Linux
  • MySQL
  • Voir toutes les compétences (15)

Langues parlées