Mes compétences :
Perl
snakemake
R
Python
Git
Docker
Ubuntu
ChIP-seq
GNU/Linux
Entreprises
Inserm
- Ingénieur d'études
PARIS 132015 - maintenantDans le cadre d'un financement de France Génomique, je travaille en lien avec la plateforme TGML et le laboratoire TAGC (Technologies Avancées sur le Génome et la Clinique) sur le ChIP-seq, notamment :
- état des lieux/state of the art
- développement de pipelines d'analyse sous snakemake
- développement d'une machine virtuelle pour l'analyse de données NGS intégrant notamment la suite RSAT (Regulatory Sequences Analysis Tools)
- création d'une liste de diffusion et d'un wiki autour du ChIP-seq en France
Inserm
- Ingénieur d'études
PARIS 132013 - 2015
Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille
- Ingénieur en bioinformatique.
Marseille2012 - 2013Bioinformaticienne au sein de l'Unité des Rickettsies.
Analyse de données brutes de spectrométrie de masse.
Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille, Inserm U891
- Création d’un pipeline d’analyse de données à haut débit.
2011 - 2011Stage de 6 mois.
Mise en place d’un pipeline d’analyse de données à haut débit issues de la cytométrie en flux.
Utilisation des langages R et Bash, des librairies Bioconductor (R).
Utilisation d’outils de calcul à haute performance.
Recherche de biomarqueurs pour le virus de l’hépatite C.
Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, CNRS UPR9027
- Prédiction des interactions protéiques membranaires.
2010 - 2010Stage de 3 mois.
Programmation d’une interface web (Python/PHP) pour la recherche de motifs d’interaction au sein des hélices alpha de protéines transmembranaires.
Étude de PufX, une protéine membranaire bitopique impliquée dans la photosynthèse chez certaines bactéries.
Hôtel du golf international de La Baule, Groupe Lucien Barrière
- Femme de chambre saisonnière
