Flavien PILLET

En résumé

Entreprises

• CNRS - PostDoctorant

  Paris 2013 - maintenant Je suis en PostDoctorat dans l'équipe de Biophysique Structurale à l'IPBS où je travaille sur la compréhension des mécanismes impliqués dans l'inactivation de bactéries soumises à des champs électriques pulsés.

• LAAS-CNRS - PostDoctorant

  2012 - 2013 Je travaille actuellement sur un contrat PostDoctoral financé par un ANR jeune chercheur et intitulé « Étude Biophysique, biochimique et biomoléculaire de la paroi des levures ».
  
  Les objectifs sont d'étudier S.Cerevisiae par microscopie à force atomique (AFM) afin de déterminer les changements morphologiques induits par différents stress, ainsi que de localiser à l’échelle de la molécule unique, des protéines de paroi.

• LISBP/INSA - Post Doctorant

  2011 - 2012 J'ai réalisé un projet de 18 mois intitulé "Études d'interactions moléculaires dans la mitose bactérienne par SPRi".
  
  Les objectifs étaient :
  
  - Étude de la partition du plasmide F chez E.coli.
  - Amélioration de la détection en SPRi.
  - Étude de différents complexes de partition bactériens issus de la famille des Burkholderiales.
  
  
  
  

• INSA Toulouse - Enseignement et formation

  2010 - 2012 - Encadrement d'un stagiaire en Master 2 professionnel sur un stage de 6 mois.
  
  - TP de biochimie analytique à des étudiants L2 Chimie Biologie physique Santé- UPS Toulouse III (67 h).
  
  - CM et TD bibliographique sur l’interaction de biomolécules uniques, à des Masters 2 microbiologie et des élèves ingénieurs- UPS Toulouse III (16 h).
  
  - Cours et TP sur la SPRi, à des 5ème année INSA- Centre Pierre Potier au cancéropôle de Toulouse (8 h).
  
  - Encadrement de Master 2 recherche sur un projet mini-thèse intitulé "Synthèse de Bioplastiques à partir de biomasse végétale".

• Genoptics Horiba - Chargé de recherche (Doctorant)

  2007 - 2010 J'ai effectué une thèse CIFRE de 3 ans intitulée "Détection d’interactions moléculaires basées sur la résonance plasmonique de surface (SPRi)". La thèse a été financée par la société Genoptics-Horiba (Orsay) et par la plateforme biopuces de Toulouse.
  
  Mon projet de thèse s’est inscrit à l’interface entre le développement technologique et la recherche fondamentale.
  
  La première partie de la thèse a consisté à répondre à plusieurs défis technologiques en SPRi. J’ai recherché et mis au point une chimie de greffage de l’ADN sur l’or qui s’affranchit des contraintes liées à l’électro-dépôt. J’ai pu ainsi augmenter la densité de dépôt en déposant plus de 1000 sondes ADN différentes, ce qui permet le criblage haut-débit en SPRi. J’ai également amélioré la détection en SPRi en augmentant la surface de contact par le greffage de nanoparticules d’or.
  
  Dans une deuxième partie, j’ai mis à profit ces avancées technologiques pour répondre à deux thématiques de recherche. En collaboration avec le Laboratoire de Chimie de Coordination (LCC), nous avons recherché des molécules permettant de limiter l’action des télomérases chez les cellules cancéreuses, en stabilisant les structures G-Quadruplex des télomères. Dans une autre étude, en collaboration avec le Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaires (LMGM), nous nous sommes intéressés aux mécanismes de partition du plasmide F d’E.Coli et plus particulièrement entre la protéine dimérique SopB et la séquence centromérique sopC.

• Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS) - Stagiaire

  2006 - 2007 J'ai effectué un stage de 9 mois dans l'équipe “biotechnologie des protéines” dirigée par le Pr Didier FOURNIER.
  
  Le stage a consisté à rechercher des analogues solubles de RCPG pas évolution moléculaire. L'objectif était de solubiliser ces protéines membranaires en substituant les acides aminés hydrophobes par des acides aminés hydrophiles.
  
  Au cours ce travail, j'ai construit des gènes synthétiques en utilisant des oligonucléotides dégénérés porteurs ou non des différentes mutations proposées. J'ai ensuite criblé les banques de gènes synthétiques obtenues à l'aide d'un rapporteur de solubilité, l'EGFP, dont la séquence codante est en aval des gènes synthétiques clonés.

• Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale (IPBS) - Stagiaire

  2005 - 2006 J'ai effectué un stage de 9 mois dans l’équipe « Interactions acides nucléiques/protéines comme nouvelles cibles thérapeutiques » dirigée par le Dr Monique Erard.
  
  La thématique du stage s'inscrivait dans l'étude de la protéine HIF et dans son rôle dans la surexpression de certains gènes impliqués dans le développement de cancers chez l'homme.
  
  Au cours du stage j'ai utilisé des techniques de biologie moléculaire et biochimie analytique pour cloner, exprimer et purifier les différentes sous-unités de HIF.

Formations

• INSA TOULOUSE (Toulouse)

  Toulouse 2007 - 2010 Doctorat CIFRE
  
  Résonance Plasmonique de Surface imagée (SPRi).
  Biopuces à ADN.
  Fonctionnalisation de surface d'or par des dendrimères et des nanoparticules d'or.
  Greffage de biomolécules sur l'or.
  Interactions ADN/ADN et ADN/protéines.

• Université Toulouse 3 Paul Sabatier

  Toulouse 2006 - 2007 Master 2 recherche
  
  DEA Structure et Fonction de Macromolécules et Processus du Vivant - Biologie moléculaire.
  Biochimie structurale.

• Université Toulouse 3 Paul Sabatier BBT

  Toulouse 2004 - 2005 Maitrise
  
  Biochimie et biologie moléculaire.
  Résonance magnétique nucléaire (RMN).
  Spectrométrie de Masse.
  Cristallographie.

• Université Toulouse 3 Paul Sabatier

  Toulouse 2003 - 2004 Licence

• Université Jean-François Champollion

  Albi 2001 - 2003 DEUG SVS

Réseau

• Amandine EGEA

• Camille LAMARCHE

• Cédric ROUVIÈRE

• Hélène SERRANO

• Julie FREDONNET

• Laurent GRENIER

• Natacha CALMELS

• Olivier ALESSANDRI

• Stéphanie HEIL (DA SILVA)

• Yannick MALBERT