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Frédéric COMMO

Villejuif

En résumé

En tant que Data Scientist, mon rôle est assez simple : transformer des masses de données afin de les rendre compréhensibles par un humain, et en extraire les informations pertinentes.

Appliquées à la médecine de précision en oncologie, ces méthodes d'analyse permettent d'identifier des cibles thérapeutiques et de proposer aux patients les traitements les plus adaptés.
Quelles sont ces cibles thérapeutiques ? Des anomalies moléculaires telles que des anomalies de séquence (mutations, délétions,...), un nombre anormal de copies de gènes, ou encore des anomalies dans la manière dont ces gènes s'expriment dans les cellules. Ces altérations moléculaires peuvent être mises en évidence par des techniques d"analyse haut débit, capables de produire une quantité d'information considérable. Mon job est de trouver quelques aiguilles dans ces meules de foin. Elles aideront les oncologues à prendre les meilleures décisions pour leurs patients.

Data Science & Bio-Statistiques
Excellente maitrise des techniques d'analyse de données haut débit: Fouille de données, Modélisation, Classification & Méthodes de décision.
Expertise dans l'analyse des données génomiques haut débit pour la médecine de précision.

Informatique
Excellente maitrise des langages R et Python.
Développement d'outils de visualisations interactives en R et javaScript.

Management
Très bonne expérience dans la conduite de projet.

Conseil
Mon excellente connaissance des techniques de laboratoire me permet de conseiller efficacement les équipes de recherche pour l'optimisation et la planification des expériences, en vue de l'analyse des données.

Enseignement
Université de Technologie de Compiègne, de 2008 à 2011. Analyse statistiques haut débit appliquées à la génomique.
IONIS School of Technology & Management, 2012. Bases de l'analyse statistique.

Publications
- 47 collaborations à des publications dans des revues scientifiques internationales à comité de lecture.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/collections/public/1DC8clzETb8ox8dQalUhoDf5q/?sort=date&direction=ascending
- 1 package R sur CRAN (nplr : Régressions logistiques pour l'analyse de courbes de réponses)
- 1 package R sur Bioconductor (rCGH : Analyse et visualisation interactive de profils génomiques)

Mes compétences :
Data mining
Biostatistiques

Entreprises

  • Gustave Roussy - Project Leader - Precision Medicine in Oncology

    Villejuif 2014 - maintenant - Optimisation des méthodes d'analyses moléculaires pour l'identification de cibles thérapeutiques.
    - Développement d'outils de visualisation partageables.
    - Analyses intégratives pour l'identification de nouveaux biiomarqueurs.
  • Sage Bionetworks, Seattle, WA - Visiting Scientist

    2012 - 2014 Data Scientist.
    In charge of High throughput data analysis for Precision Medicine programs.
    Methodological developments.
  • Institut Gustave Roussy - Ingénieur de Recherche Biostatistiques

    Villejuif 2007 - 2012 Analyses haut débit. Meta-analyses. Projet microarray fonctionnel.
    En charge de l'analyse de données dans les programmes de médecine personnalisée.

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