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Noel MAGNIN

Paris

En résumé

Voir également mon profil LinkedIn qui est actualisé plus fréquemment :
http://fr.linkedin.com/pub/noelmagnin/
Expérience professionnelle en recherche, principalement biologie végétale et microbiologie, avec une pratique experte de la bioinformatique. Mon approche est de gérer les projets, former mes collaborateurs, solutionner les problèmes, évaluer la pertinence des résultats, gérer la communication des résultats, m'assurer d'un bon retour sur investissement des projets. L'efficacité est une question de personne et d'expérience, c'est ce que je propose.
Je peux appliquer mes connaissances / compétences dans les domaines de la biologie et du développement d'innovations sur les sujets suivants (pas d'ordre préférentiel) :
- agriculture/viticulture de précision. Il y a beaucoup à faire dans ce domaine, les solutions commerciales proposées sont peu adaptées aux possibilités offertes par la technologie actuelle. La plupart des acteurs sont très technophiles (ingénieurs en analyse d'image, ingénieurs en statistiques...) mais ignorent totalement l'aspect agronomique. Par contre ils sont appuyés par les forces marketing.
- production de métabolites par bactérie/champignons. ex : antibioitiques, molécules anti-cancéreuses. Il est actuellemnt urgent de produire de nouvelles molécules antibiotiques contre lesquelles les pathogènes humains ne présentent pas de résistance. Une étude biblio approfondie m'a permis de déterminer que les voies "cryptiques" nécessitent deux conditions pour s'exprimer : co-cultivation et stress. Je peux développer ce type de projet pour la compétitivité de l'entreprise intéressée.
-production de métabolites par ingénierie biotechnologique (saveur, parfums ...). Ici, pas de process générique car chaque cas est particulier. Par contre, il est nécessaire de trouver des solutions meilleures que le passage par la fermentation.
- analyses de données biologiques, mise en place de projets de biologie incluant les technologies haut-débit. Trop souvent, les projets avec composante haut-débit sont répartis entre biologistes et (bio)informaticiens. La relation entre ces deux catégories n'est pas optimale (incompréhension mutuelle) et une bonne connaissance des deux domaines est requise pour être réellement efficace. C'est ma spécialité.

Mes compétences :
Biologie moléculaire
Génomique
Biochimie
Bioinformatique
Automates
R&D
Innovation
Agriculture de precision
Gestion du personnel
Management
Gestion de projet
Agile Development
Développement produit
Business development

Entreprises

  • INRA - Chercheur

    Paris 2009 - 2018 Biologie plante (vigne) / pathogènes (mildew, oïdium, esca)
    Bioinformatique
  • Université Bordeaux 2 - CHU Bordeaux - Chercheur

    2005 - 2008 Hôpital Bordeaux (CHU Pellegrin – Virologie) et Université Bordeaux 2 (Virologie)
    - Collecte et intégration de données biologiques et cliniques dans une base de données. Relationnel avec la Société Smartgene pour la mise en place de la base de données et les ajustements
    - Analyses de séquences VIH (phylogénie, polymorphisme, mutations, et statistiques).
    - Assistance technique à l’installation d’un système robotisé d’extraction d’acides nucléiques d’échantillons biologiques (sérum, plasma) et d’analyse quantitative par PCR.
    - Assistance générale au personnel technique: PCR, séquençage et informatique, dont utilisation de la base de données (intégration des données, interrogation de la base).
  • Commission Communautés Européennes - Expert-Evaluateur

    2004 - 2004 Expert pour la Commission des Communautés Européennes (mars/avril 2004)
    - Analyses de “Projets Intégrés” pour la CCE - Panel “Food quality and safety” 6ème PCRD.
  • Université Bordeaux 2 - Ingénieur Bioinformatique

    Bordeaux 2001 - 2003 Analyse de données biologiques (ADN et protéines)
    Installation de bases de données (SQL, PostgreSQL)
    Programmation (Perl, SQL) et développement web (PHP, HTML, XML)
  • Université Bordeaux 1 - Enseignant-Chercheur

    Talence 1999 - 2000 Enseignements de botanique, biochimie, biologie moléculaire.
    Installation d’un système bioinformatique (Linux) pour le laboratoire de recherche sur la vigne.
  • Université d'Odense / Biochemistry Institute - Chercheur

    1997 - 1998 Conception et réalisation d'expériences de biologie moléculaire et bioinformatique dans le cadre du programme 'TMR network on Green Bacterial Photosynthesis: Structure, Function and Regulation of Light-harvesting Systems and Core Complexes' de la Commission des Communautés Européennes. Sujet de recherche : "Photosynthèse des bactéries sulfureuses anaérobiques : approche moléculaire". Direction des recherches : Dr. M. Miller . Coordinateur du projet TMR : Prof. Jan Amesz (Netherlands).
    Réalisations :
    . clonage, séquençage, analyses de séquences
    . encadrement d'étudiants en Thèse (expression hétérologue de protéines) et Master (analyse du photosystème par Maldi-tof)
  • University of Florida - Botany Department - Chercheur

    1995 - 1997 Conception et réalisation d'expériences (Biochimie des protéines, Biologie moléculaire) dans le cadre de projets de recherche financés en premier lieu par USDA puis par NSF.
    Conception et rédaction de la partie biologie moléculaire du projet de recherche soumis à USDA, DOE, NSF; projet NSF accepté en 1996 pour la poursuite du projet que j'ai élevé au niveau des technologies moléculaires.
    Installation de la biologie moléculaire au sein du laboratoire (collaboration avec Drs W. Farmerie et R. Ferl)
  • Université de Londres - Royal Holloway College - Biochemistry Dept - Chercheur (doctorant)

    1991 - 1995 Sujet de recherche : "Maturation post-traductionnelle du complexe photosystème II des plantes supérieures". Directeur de thèse : Prof. J.R. Bowyer (décédé) - Conseil scientifique : Dr. P.M. Bramley .
    Expérience acquise en biochimie des protéines : purification d'une protéase présente dans les chloroplastes des plantes supérieures, conception de protocoles de purification, d'essais enzymatiques.

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