MilleGen
- Chef de Projet
2006 - 2013
Missions : gestion des projets internes, de contrats de service et de collaborations extérieures
• Gestion et réalisation des projets d’amélioration d’affinité d’anticorps et de projets de criblages de banques d’anticorps humains : conception, faisabilité, planification et réalisation des différentes tâches.
• Suivi client, rédaction des rapports d’avancement et de fin d’étude.
• Collaboration avec L’Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier IRCM depuis 2009 : sélection, production et caractérisation d’anticorps spécifiques de récepteurs à tyrosine kinase HER3 et HER4. Participation au dossier de financement FUI13 UmabHER3, suivi d’une doctorante CIFRE.
• Travaux en étroite collaboration avec le service Bioinformatique pour la création et le développement d’une base de données permettant l’intégration des différentes données issues des projets de criblage d’anticorps et d’amélioration d’affinité (séquences, annotations, analyses, caractérisations).
• Management : encadrement d’ingénieurs, techniciens, doctorant, stagiaires master. Organisation du travail d'équipe, suivi avancement des projets. Recrutement (formulation offres d'emploi et entretiens)
• Rédaction des parties scientifiques des dossiers de demande de financement, de demande de brevets, et d’articles. Participation à la réalisation des présentations scientifiques conjointement avec le responsable Business Developpement .
• Articles:
- 2 articles en préparation pour début 2013 (collaborations IRCM et LFB Biotechnologies) portant sur la sélection et l’optimisation d’anticorps d’intérêt en oncologie
- Lazrek Y, Dubreuil O, Garambois V, Gaborit N, Larbouret C, Le Clorennec C, Thomas G, Leconet W, Jarlier M, Pugnière M, Vié N, Robert B, Monnet C, Bouayadi K, Kharrat H, Mondon P, Pèlegrin A, Chardès C. Anti-HER3 domain 1 and 3 antibodies reduce tumor growth by hindering HER2/HER3 dimerization and AKT-induced MDM2, XIAP and FoxO1 phosphorylation. Neoplasia, March 2013.
- Renaud L, Monnet C, Dubreuil O, Zaki 0, Crozet F, Bouayadi K, Kharrat H, Mondon P. Affinity Maturation of Antibodies: Optimized methods to generate high-quality scFv libraries and isolate IgG candidates by high-throughput screening. Methods mol Biol 2012;907:451-61.
- Mondon P, Dubreuil O, Bouayadi K, Kharrat H. Human antibody libraries: a race to engineer and explore a larger diversity. Front Biosci. 2008 Jan 1;13:1117-29. Review.
- Mondon P., Dubreuil O., Bouayadi K., Kharrat H. Les technologies des anticorps recombinants : Quel avenir pour les anticorps ?. Biofutur N°258, pp 34-40, 2005.
• Brevet :
- Dubreuil O et al., Antibodies against HER3. EP11305583.4.
BioMérieux (UMR CEA Saclay)
- Chercheur Doctorant (contrat CIFRE)
2001 - 2005
Sujet de thèse : "Amélioration de la spécificité de reconnaissance d’un anticorps diagnostic anti-progestérone par évolution moléculaire dirigée".
Cet anticorps anti-progestérone présentait de fortes réactions croisées vis-à-vis d’analogues de la progestérone qui peuvent être présents dans le sang des patients. Cet anticorps était déjà utilisé dans une trousse de dosage commercialisée par BioMérieux.
• Ce projet de thèse a été très formateur et m’a permis de me familiariser avec l’ensemble des techniques de biologie moléculaire et de biochimie allant du séquençage d’hybridome à la production des anticorps améliorés : stratégie de mutagenèse dirigée et aléatoire, analyse structure tridimensionnelle, construction de banques de variants, criblage par Phage Display, caractérisation par ELISA, RIA et BiaCore, production en système E.coli et purification de fragments d’anticorps par affinité Ni-NTA. L’ensemble de ces travaux ont été réalisés sous contrôle qualité propre au département R&D de Biomérieux (norme ISO9001). In fine, les anticorps améliorés ont été fournis au Département Developpement.
• Gestion de projet (2003-2004) : collaboration scientifique avec la société BIOMETHODES qui consistait à évaluer leur stratégie de mutagenèse propriétaire: design mutagenèse basée sur l’analyse structure tridimensionnelle d’une intéraction anticorps-antigène, conception et mise en place de la stratégie de criblage haut-débit par ELISA. Le succès de la collaboration a été publié par communiqué de presse.
• Encadrement : techniciens, stagiaires DEA et BTS
• Articles :
- Dubreuil O, Muller B, Bossus M, Savatier A & Ducancel F. [Directed molecular evolution of antibodies], [French]. Journal de la Société de Biologie, 355-363 (2006).
- Dubreuil O., Bossus M., Graille M., Bilous M., Savatier A., Jolivet M., Ménez A. Stura E. & Ducancel F.Fine-Tuning of the specificity of an anti-progesterone antibody by first and second sphere residues engineering. Journal of Biological Chemistry, Vol 280, N° 26, Jul 1, pp.24880-24887, 2005.
• Brevets :
- Dubreuil O., Ducancel F. Method for preparing specific affinity anti-progesterone antibodies, the obtained antibodies and the use thereof for in vitro diagnosis. W02006048576.
