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Romain PARDOUX

Paris

En résumé

Mes compétences :
Bioinformatique
Enzymologie
Informatique
Biochimie
Biologie moléculaire
Biophysique
Microbiologie

Entreprises

  • CNRS - CDD chercheur

    Paris 2013 - 2016 Caractérisation biochimique et analyse phénotypique d’une protéine impliquée dans la maturation des protéines à centre [Fe-S] issue de la bactérie anaérobie Desulfovibrio vulgaris Hildenborough.
  • Université Aix-Marseille - Enseignant

    2011 - 2011 Vacations - Enseignement niveau L2 (Travaux dirigés) – Biophysique et optique.
  • Université Aix-Marseille - Enseignant

    2010 - 2010 Vacations - Enseignement niveau L2 (Travaux dirigés) – Biophysique et optique.
  • Commissariat à l'Energie Atomique (CEA) - Doctorat en Biologie/Biochimie

    2009 - 2012 Optimisation de sites protéiques de fixation de l'uranium

    Résumé du sujet

    Le sujet de thèse concerne la mise au point de structures chélatantes affines et spécifiques de l'uranium dans le but d'optimiser des pproches de biodépollution ou de décorporation de ce toxique. Ces structures sont développées à partir d'une des boucles de fixation du calcium de la calmoduline par mutagénèse dirigée. Ce sujet implique la mise en oeuvre d'approches de biochimie, de biologie moléculaire et de chimie. Les interactions peptide-uranium sont caractérisées par spectroscopie par fluorescence (résolue en temps), spectrométrie de masse et spectroscopie infrarouge.

    Techniques de Biochimie (expression et purification de protéines, western blot...) de Biologie moléculaire (mutagenèse dirigée et biologie moléculaire classique) et d'analyse spectroscopique spectrophotométrie, spectrofluorimétrie, FTIR (infrarouge), EXAFS, spectrométrie de masse)
  • CEA (Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives) Cadarache - Chargé de projet

    2008 - 2009 Stage de microbiologie au laboratoire de bioénergétique cellulaire (LBC/IBEB/CEA Cadarache) : « Fonctionnalisation de particules magnétiques bactériennes ».

    Techniques de biologie moléculaire classique (pcr, réaction enzymatique...) et microscopie électronique.
  • IBDML (Institut de Biologie du Développement de Marseille Luminy) - Bioinformaticien

    2008 - 2008 Vacations - Modélisation en 3D d’embryon de l'organisme marin Ciona intestinalis. Utilisation de logiciels de modélisation 3D tel que Amira et 3DsMax.
  • Fermentas - Ingénieur technico-commercial

    2008 - 2008 CDD - Développement des ventes de produits de biologie moléculaire (gamme Fermentas) sur Marseille.
  • IRD (Institut de Recherche pour le Développement) - Chargé de projet

    2008 - 2008 Stage de microbiologie au laboratoire de microbiologie des environnements chauds (LMEC IRD Université Aix-Marseille II) : « Etude des capacités de dégradation des hydrocarbures par Archaeoglobus profundus ».

    Techniques de microbiologie anaérobie, HPLC…
  • CNRS (Centre national de la recherche scientifique) - Chargé de projet

    2006 - 2007 Stage de microbiologie au laboratoire de chimie bactérienne (LCB CNRS Université Aix-Marseille II) : « Analyse des interactions entre la formiate déshydrogénase H et les protéines accessoires FDHE et FDHD d’Escherichia Coli par la méthode du double hybride bactérien ».

    Techniques de microbiologie, génétique, biologie moléculaire et biochimie.
  • IMEP (Institut méditerranéen d'écologie et de paléoécologie) - Chargé de projet

    2006 - 2006 Stage de microbiologie et enzymologie au laboratoire d’Ecologie Microbienne (IMEP CNRS Université Aix-Marseille III) : « Etude des effets du lessivage sur l’activité respiratoire et les processus enzymatiques impliqués dans la biodégradation de la litière de chêne vert ».

    Extractions et dosages enzymatiques des laccases, peroxydases, phosphatases basiques, cellulases… Respirométrie (mesure de la DBO), Spectrométrie.

Formations

  • Université Aix Marseille 2 Mediterranée

    Marseille 2009 - 2012 Doctorat
  • Université Aix Marseille 2 Mediterranée (Marseille)

    Marseille 2007 - 2009 Master 2

    Microbiologie, biologie végétale et bioyechnologies
  • Université Aix Marseille 2 Mediterranée (Marseille)

    Marseille 2004 - 2007 Licence

    biologie cellulaire
  • Lycée Emile Zola (Aix En Provence)

    Aix En Provence 2003 - 2004 Baccalauréat

    STT

Réseau

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