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Sandrine CAPUTO-DURAND

LIMEIL-BREVANNES

En résumé

Publications:
-Béroud C, Letovsky SI, Braastad CD, Caputo SM, et al. (2016) “BRCA Share: A Collection of Clinical BRCA Gene Variants. ” Human Mutation (accepted)
-de la Hoya M., ......, Caputo S.M., et al. (2016) “Combined genetic and splicing analysis of BRCA1 c.[594-2A > C; 641A > G] highlights the relevance of naturally occurring in-frame transcripts for developing disease gene variant classification algorithms.” Hum Mol Genet. 25(11):2256-2268
-Golmard L., ....., Caputo S., et al. (2015) “Breast and ovarian cancer predisposition due to de novo BRCA1 and BRCA2 mutations.” Oncogene (accepted)
-Jhuraney A., ......, Caputo S.M., et al. (2015) “BRCA1 CIRCOS: A visualization resource for functional analysis of missense variants” J. Med. Genet. 52(4):224-30.
-Caputo S.M.*, Guidugli L*, Carreira A*, et al. (2014) “Functional Assays for Analysis of Variants of Uncertain Significance in BRCA2.” Hum. Mutation 35(2):151-64
-Gaildrat P., Krieger S., Digiacomo D., Abdat J., Révillion F., Caputo S., et al. (2012) “Multiple splicing regulatory elements are altered by sequence variants in BRCA2 exon7.” J. Med. Genet. 49(10):609-17
-Spurdle A.B., ....., Caputo S., et al. (2012) “The BRCA1 R1699Q variant displaying ambiguous functional abrogation confers an intermediate risk of breast and ovarian cancer.” J. Med. Genet. 49(8):525-532
-Millot G.A., Carvalho M.A., Caputo S.M., et al. (2012) “A Guide for Functional Analysis of BRCA1 Variants of Uncertain Significance (VUS).” Hum Mutat. 33(11):1526-37
-Rouleau E, ....., Caputo S, et al (2012) “Rare germline large rearrangements in the BRCA1/2 genes and eight candidate genes in 472 patients with breast cancer predisposition.” Breast Cancer Res Treat.
-Spurdle AB, et al. (2012). “ENIGMA--evidence-based network for the interpretation of germline mutant alleles: an international initiative to evaluate risk and clinical significance associated with sequence variation in BRCA1 and BRCA2 genes.” Hum Mutat. 33(1):2-7
-Caputo S., et al (2012). “Description and analysis of genetic variants in French hereditary breast and ovarian cancer families recorded in the UMD-BRCA1/BRCA2 databases.” Nucleic Acids Res. 40(Database issue):D992-1002.
-Muller D., Rouleau E., Schultz I., Caputo S., et al (2011). “An entire exon 3 germ-line rearrangement in the BRCA2 gene: pathogenic relevance of exon 3 deletion in breast cancer predisposition.” BMC Medical Genetics 12:121.
-Kondé E, Bourgeois B, Tellier-Lebegue C, Wu W, Pérez J, Caputo SM, et al (2010). “Structural analysis of the Smad2-MAN1 interactions that regulates transforming growth factor-ss signaling at the inner nuclear membrane.” Biochemistry 49(37):8020-32.
-Rouleau E., Lefol C., Moncoutier V., Castera L., Houdayer C., Caputo S., et al (2010). “A missense variant within BRCA1 exon 23 causing exon skipping.” Cancer Genetics and Cytogenetics, 202(2):144-6.
-Verstraeten V. L., Caputo S., et al (2009). “The R439C mutation in LMNA causes lamin oligomerisation and susceptibility to oxidative stress.” J. Cell. Mol. Med., 13(5), 959-71.
-Aliprandi P., Sizun C., Perez J., Mareuil F., Caputo S., et al (2008). “S1 ribosomal functions in translation initiation and ribonuclease RegB activation are mediated by similar RNA/protein interactions: a NMR and SAXS analysis.” J. Biol. Chem., 283(19),13289-301.
-Caputo S., et al (2006). "The carboxyl-terminal nucleoplasmic region of MAN1 exhibits a DNA binding winged helix domain." J. Biol. Chem., 281(26),18208-18215.
-Caputo S., et al (2006). "NMR assignment of Region 655-775 of Human MAN1." J. Biomol. NMR, 36:2.

Mes compétences :
RMN
Biologie structurale
Spectrométrie
Gestion de projet
Biochimie
Biophysique
Biologie moléculaire

Entreprises

  • Institut Curie - Site Paris - Chercheur

    2013 - maintenant Service de génétique
    Projet de recherche : Gestion de la base nationale de mutations de BRCA1 et BRCA2, protéines responsables du cancer du sein: UMD-BRCA1/BRCA2 ( http://www.umd.be/BRCA1/ et http://www.umd.be/BRCA2/) (Financement INCA).

    • Conduite de projets:
    -design et réalisation d'expériences,
    -exploitation des résultats
    • Encadrement d’étudiants de M2 et de thèse dans la conduite d’expériences et la rédaction
    • Rédaction de projets de recherche et d’articles
    • Responsable scientifique de l'étude COVAR: https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT01689584
    • Collaborations avec les laboratoires de diagnostic BRCA1/2 français et des consortiums internationaux:
    -UNICANCER Genetic Group (http://www.unicancer.fr/la-recherche-unicancer/les-groupes-transversaux/groupe-genetique-cancer-ggc)
    -ENIGMA (https://enigmaconsortium.org/)

    Responsables : Pr Dominique Stoppa-Lyonnet et Dr Claude Houdayer

  • Institut Curie - Hôpital René Huguenin - Chercheur

    PARIS 5 2009 - maintenant Chercheur / Service Oncogénétique - St Cloud (92, France)
    Projet de recherche : Gestion de la base nationale de mutations de BRCA1 et BRCA2, protéines responsables du cancer du sein: UMD-BRCA1/BRCA2 (http://www.umd.be/BRCA1/ et http://www.umd.be/BRCA2/) (Financement INCA)
    Responsable : Dr Rosette Lidereau

    Publications:
    - Gaildrat P., Krieger S., Digiacomo D., Abdat J., Révillion F., Caputo S., Vaur D., Jamard E., Bohers E., Peyrat JP., Houdayer C., Lidereau R., Frébourg T., Hardouin A., Tosi M., Martins A. and the French BRCA GGC Consortium. (2012) “Multiple splicing regulatory elements are altered by sequence variants in BRCA2 exon7.” J. Med. Genet. 49(10):609-17.
    - Spurdle A.B., Whiley P.J., Thompson B., Feng B.J., Healey S., Brown M.A., Pettigrew C., kConFab, .., Meindl A., German Consortium of Hereditary Breast and Ovarian Cancer, Caputo S., Sinilnikova O.M., Lidereau R., French GGC Consortium, Couch F.J., Guidugli L., Hansen T.v.O., Thomassen M., Eccles D.M., Benitez J., Domchek S.M., Toland A.E., van Rensburg E.J., Wappenschmidt B., Borg A., Vreeswijk M.P.G., and Goldgar D.E., on behalf of the ENIGMA Consortium. (2012) “The BRCA1 R1699Q variant displaying ambiguous functional abrogation confers an intermediate risk of breast and ovarian cancer.” J. Med. Genet. 49(8):525-532
    - Millot G.A., Carvalho M.A., Caputo S.M., Vreeswijk M.P.G., Brown M.A., Webb M., Rouleau E., Neuhausen S.L., Hansen T.v.O., Galli A., Brandão R.D., Blok M.J., Velkova A., Couch F.J., Monteiro A.N.A. on behalf of the ENIGMA (Evidence-based Network for the Interpretation of Germline Mutant Alleles Consortium) Functional Assay Working Group. (2012) “A Guide for Functional Analysis of BRCA1 Variants of Uncertain Significance (VUS).” Hum Mutat.
    - Rouleau E, Jesson B, Briaux A, Nogues C, Chabaud V, Demange L, Sokolowska J, Coulet F, Barouk-Simonet E, Bignon YJ, Bonnet F, Bourdon V, Bronner M, Caputo S, Castera L, Delnatte C, Delvincourt C, Fournier J, Hardouin A, Muller D, Peyrat JP, Toulas C, Uhrhammer N, Vidal V, Stoppa-Lyonnet D, Bieche I, Lidereau R. (2012) “Rare germline large rearrangements in the BRCA1/2 genes and eight candidate genes in 472 patients with breast cancer predisposition.” Breast Cancer Res Treat. (accepted).
    - Spurdle AB, Healey S, Devereau A, Hogervorst FB, Monteiro AN, Nathanson KL, Radice P, Stoppa-Lyonnet D, Tavtigian S, Wappenschmidt B, Couch FJ, Goldgar DE; ENIGMA.
    Collaborators : Goldgar D, Couch F, Fackenthal JD, Thomassen M, Teo SH, Hansen TV, Borg Å, Eeles R, Toland A, Rogan P, Hansen TV, Guidugli L, Brody LC, Healey S, Brown M, .., Caputo S, Houdayer C, Blanco I, Lázaro C, Whiley P, Becker A, Aretini P, Eccles D, Caldes T, Viel A, Izatt L, Hogervorst F, Radice P, Nathanson K, Pedersen IS, Vreeswijk M, Neuhausen S, Yannoukakos K, Tucker K, Southey M, Leary J, Caligo MA, Garcia EG, Devereau A, Brandao R, Lidereau R, Montagna M, Pertesi M, Cornell M, Rouleau E, Sharan S, Rahman N, Lalloo F, Weitzel J, Campbell J, Cummings, Machakova E, Olopade F, Godwin A, Ozcelik H, Seminara D. (2012). “ENIGMA--evidence-based network for the interpretation of germline mutant alleles: an international initiative to evaluate risk and clinical significance associated with sequence variation in BRCA1 and BRCA2 genes.” Hum Mutat. 33(1):2
    - Rouleau E., Lefol C., Moncoutier V., Castera L., Houdayer C., Caputo S., Bièche I., Buisson M., Mazoyer S., Stoppa-Lyonnet D., Noguès C. and Lidereau R. (2010). “A missense variant within BRCA1 exon 23 causing exon skipping.” Cancer Genetics and Cytogenetics, 202(2):144-6.
  • ICSN Ecole Polytechnique CNRS - Chercheur Post-doctorant

    2007 - 2009 Chercheur / CNRS-ICSN et Ecole Polytechnique – Gif sur Yvette et Palaiseau (91, France)
    Projet de recherche : Etude des propriétés structurales et fonctionnelles de la protéine S1 du ribosome d’E. coli (http://www.icsn.cnrs-gif.fr/article.php3?id_article=516)
    (Financement ICSN)
    • Etude de faisabilité sur 2 ans
    • Conduite d’une étude ayant pour objectif de :
    - définir les interactions de la protéine S1 avec l’ARN par RMN pour la compréhension du mécanisme d’action
    - utiliser des sondes paramagnétiques greffées aux ARNs en RMN
    - réaliser des expériences de relaxation (RMN)
    • Encadrement d’étudiants de thèse dans la conduite d’expériences : biochimie et RMN
    • Collaborations avec les laboratoires de ICSN/RMN à hauts champs (Jean-Louis Leroy) et de Cristallographie et RMN biologiques (Sylvie Nonin-Lecomte) pour la synthèse et/ou production et purification d’ARN
    • Rédaction d’articles
    • RMN (2D et 3D, Relaxation, interaction protéine-protéine/ARN) ; Expression, production et purification de protéines recombinantes chez E. coli, Chromatographie (Gel filtration, chromatographie par affinité), Gels SDS-PAGE, Synthèse et purification d’ARN, Dichroïsme Circulaire, ITC
    • Appareillage utilisé :
    - RMN : Bruker Advance 600MHz, 700MHz, 950MHz
    - Biochimie : ÄKTApurifier
    Responsables : Dr François Bontems (Equipe Lallemand)

    Publications:
    - Aliprandi P., Sizun C., Perez J., Mareuil F., Caputo S., Leroy J.-L., Laalami S., Uzan M. and Bontems F. (2008). “S1 ribosomal functions in translation initiation and ribonuclease RegB activation are mediated by similar RNA/protein interactions: a NMR and SAXS analysis.” J. Biol. Chem., 283(19),13289-301.
  • CEA - Chercheur Doctorante

    PARIS 2002 - 2006 Chercheur / CEA / Département d’Ingénierie et d’Etude des Protéines – Saclay (91, France)
    Projet de recherche : Analyse structurale de protéines de l’enveloppe nucléaire impliquées dans des pathologies génétiques. (http://www-dsv.cea.fr/dsv/instituts/institut-de-biologie-et-de-technologies-de-saclay-ibitec-s/unites/service-de-bioenergetique-biologie-structurale-et-mecanismes-sb2sm-ura-2096-cnrs/laboratoire-de-biologie-structurale-et-radiobiologie-lbsr/equipe-analyse-de-complexes-proteiques-par-rmn-et-cristallographie-b.-gilquin/projets-de-recherche/structure-de-l-enveloppe-nucleaire-interne-et-role-dans-la-signalisation-cellulaire-assemblage-de-grands-complexes-viraux-sophie-zinn-justin)
    (Financement CEA et AFM)
    • Etude de faisabilité sur 4ans et 6mois
    • Conduite d’une étude ayant pour objectif de :
    - mettre au point des conditions d’expression, de production et de purification de domaines de protéines membranaires recombinantes chez E. coli
    - déterminer la structure 3D de domaines de protéines par RMN
    - déterminer les interactions de domaines de protéines avec des partenaires potentiels
    • Encadrement d’étudiants de master et de thèse dans la conduite d’expériences : biochimie et RMN
    • Collaborations avec les équipes de Jean-Claude Courvalin (Institut Jacques Monod, Paris, France), de Maurice A.M. van Steensel (Research Institute GROW, Maastricht, the Netherlands) et de Howard J. Worman (Columbia University, New-York, USA)
    • Rédaction d’articles
    • RMN (2D et 3D, interaction protéine-protéine/ADN), Biologie moléculaire (mutagenèse dirigée, amplification de plasmide), Biochimie : Expression, production et purification de protéines recombinantes chez E. coli, Chromatographie (Gel filtration, chromatographie par affinité, chromatographie par échange d’ions), Gels SDS-PAGE, Western Blot, Gels retards, GST-pulldown, Dichroïsme Circulaire, BIACORE, Cristallogenèse, Modélisation moléculaire, Culture cellulaire (notions)
    • Appareillage utilisé :
    - Biochimie : ÄKTApurifier, Gradifrac, Biorad
    - RMN : Bruker Advance 600MHz, 700MHz
    Responsables : Drs. Bernard Gilquin et Sophie Zinn-Justin (CEA)

    Publications:
    - Kondé E, Bourgeois B, Tellier-Lebegue C, Wu W, Pérez J, Caputo SM, Attanda W, Gasparini S, Charbonnier JB, Gilquin B, Worman HJ, Zinn-Justin S. (2010). “Structural analysis of the Smad2-MAN1 interactions that regulates transforming growth factor-ss signaling at the inner nuclear membrane.” Biochemistry 49(37):8020-32.
    -Verstraeten V. L., Caputo S., van Steensel M. A., Duband-Goulet I., Zinn-Justin S., Kamps M., Kuijpers H.J., Östlund C., Worman H. J., Briedé J. J., Le Dour C., Marcelis C. L., van Geel M., Steijlen P.M., van den Wijngaard A., Ramaekers F. C. and Broers J. L. (2009). “The R439C mutation in LMNA causes lamin oligomerisation and susceptibility to oxidative stress.” J. Cell. Mol. Med., 13(5)
    - Caputo S., Couprie J., Duband-Goulet I., Kondé E., Lin F., Braud S., Gondry M., Gilquin B., Worman H. J., Zinn-Justin S. (2006). "The carboxyl-terminal nucleoplasmic region of MAN1 exhibits a DNA binding winged helix domain." J. Biol. Chem., 281(26),18208-18215.
    - Caputo S., Lin F., Gilquin B., Worman H. J., Zinn-Justin S., Couprie J. (2006). "NMR assignment of Region 655-775 of Human MAN1." J. Biomol. NMR, 36:2.
  • COVENTYA - Stagiaire

    Villeneuve-la-Garenne 2001 - 2001 Chercheur Stagiaire / Coventya – Clichy la Garenne (92).
    Dans le cadre du stage de maitrise (3 mois): Mise au point d’un spectromètre UV avec fibre optique et d’un appareil à voltamétrie cyclique.
    Utilisation de la spectrométrie UV et de la voltamètrie cyclique
  • Conforama - Hôtesse d’accueil

    Marne-la-Vallée 2000 - 2002
  • Casino cafétéria - Employée polyvalente

    1997 - 2000
  • Centre de Loisirs - Animatrice

    1995 - 2000 Obtention du BAFA
  • Croix-Rouge - Bénévole (Responsable formation pendant 3ans et Directrice pendant 2ans)

    Paris 1995 - 2001 Croix-Rouge
    Bénévole (Responsable formation pendant 3ans et Directrice pendant 2ans) dans un comité Croix Rouge de 1995 à 2001, obtention de l’AFPS, BNPS, opérateur radio, CFAPSE

Formations

Réseau

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