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Alboukadel KASSAMBARA

Montpellier Cedex 2

En résumé

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Présentation générale
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Docteur en Biologie-santé de l’Institut de Recherche en Biothérapie de Montpellier, ma mission principale est d’identifier, par des approches Biostatistiques, des biomarkers (indicateurs) thérapeutiques dans le myélome multiple en analysant des données cliniques et biologiques des patients. Ces biomarkers sont par la suite validés par des études fonctionnelles passant par l’utilisation d’approches de surexpression et d’extinction génique en utilisant des outils lentiviraux.

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Perspectives professionnelles
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Je suis actuellement intéressé par toute offre de post-doc en cancérologie ou un emploi dans les secteurs de l'industrie pharmaceutique et les biotechnologies en France ou à l’international.

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Savoir-être
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Je suis enthousiaste, diplomate, et à l’écoute des consignes. Très à l’aise dans mes relations avec les autres, j’aime travailler en groupe tout en gardant mon sérieux et mon implication.


Je m’adapte aussi vite aux règles, à la technique et à chaque membre du groupe.



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Compétences
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### Compétences théoriques ###
Epigénétique, biologie moléculaire et cellulaire, biologie du développement et différenciation cellulaire, biochimie, microscopie, physiologie humaine et végétale.

### Compétences techniques ###
Transfection, production lentivirale et infection de cellules, ImmunoPrécipitation de la Chromatine (ChIP), clonage, PCR classique et quantitative, extraction d’ARN et RT-QPCR, Western-Blot, culture cellulaire, test ELISA, analyses de données transciptomiques (transcriptome, puce miRNA, puce épigénétique, puce SNP) et FACS.

### Compétences en Bioinformatique/Biostatistique ###
*** Maitrise parfaite de l’environnement de programmation R pour l’analyse « donnée à haut débit »

** Développement de logiciels d’analyse de donnée par l’utilisation du langage C++/QT

** Conception d’interface Web (langages XHTML/CSS, MySQL et PHP)

** Tests statistiques : Student, wilcoxon, khi2, Log-rank (courbe de survie), test de corrélation

** Analyse multifactorielle : Analyse en composante principale (ACP), Analyse factorielle des correspondances simples (AFC) et multiples (ACM)

** Logiciels : R, SPSS, Genotyping Console (GTC), Bureautique (Excel, PowerPoint, word), Cluster et TreeView , photoshop, ImageJ

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Communication
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** Rédaction d’articles scientifiques, Standardisation de protocoles de recherche

** Communication orale (séminaires internes, congrès nationaux et internationaux)


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Gestion et encadrement
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Suivi de commandes et gestion des stocks (matériels et consommables) ; suivi de stagiaires et veille bibliographique ; gestion de projet de recherche.

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Langue vivante
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Anglais scientifique

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Mes compétences :
Bactériologie
Bio-informatique
Biochimie
Bioinformatique
Biologie
Biologie moléculaire
Biologie moléculaire et cellulaire
Biostatistique
Clonage
Epigénétique
Immunologie
Production
Vectorologie

Entreprises

  • Université Montpellier 1 - Doctorant en Biologie-santé

    Montpellier Cedex 2 2007 - 2011 - Etude de la biologie du myélome multiple.
    - Développement d'outils bioinformatiques d'analyse statistique de données microarrays ( transcriptome, puce miRNA et SNP)

    - Publications scientifiques associées :

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    *** Gene expression profile of ADAMs and ADAMTSs metalloproteinases in normal and malignant plasma cells and in the bone marrow environment.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21316416
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    ***Osteoclast-gene expression profiling reveals osteoclast-derived CCR2 chemokines promoting myeloma cell migration.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21097672
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    ***The role of IGF-1 as a major growth factor for myeloma cell lines and the prognostic relevance of the expression of its receptor.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19228610
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    ***MMSET is overexpressed in cancers: link with tumor aggressiveness.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19121287
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    ##### Présentations orales ######
    1.Kassambara A. Genes shared by myelomacells and environment cells can strongly predict for poor survival of patients with MM. Conférence MSCNET (Myeloma Stem Cell Network) à Montpellier. Janvier 2009.
    2.Kassambara A. Spiked genes, Heidelberg. Avril 2009
  • Institut Albert Bonniot de Grenoble - Stage Master I & II

    2006 - 2007 Analyse quantitative des modifications épigénétiques associées aux rémaniements 1q12 dans les lymphomes folliculaires

    Publication scientifique associée:

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    1q12 chromosome translocations form aberrant heterochromatic foci associated with changes in nuclear architecture and gene expression in B cell lymphoma.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20432501
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