TOULOUSE
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Biologie moléculaire :
• Clonage : Design d’amorces, Topo cloning, Gateway, PCR, Digestion enzymatique, Purification, Ligation.
• Transformation et Transfection : Bactérie (choc thermique, électroporation), Levures (transformation de librairie peptidique, scale up), Cellules humaines, Cellules végétales (agro-infiltration).
• Préparation échantillons : Extraction d’ADN (ADN génomique et plasmidique) et d’ARN, Purification de plasmides et d’amplicons.
• Analyse et modification : Electrophorèse sur gel agarose, PCR, RT-PCR, Southern blot, Mutagenèse dirigée, Optimisation de plasmide.
Biochimie des protéines :
• Test d’interaction : Double hybride en levure et en cellules humaines (protéine / peptide), Phage display (protéine / sucre).
• Préparation échantillons : Extraction protéique, Dessalage, Lyophilisation, Préparation de paroi de cellules végétales, Digestion enzymatique (Trypsine et Chymotrypsine).
• Purification de protéines : Utilisation de système de pilotage FPLC (AKTA), Chromatographie échangeuse d’ions, Chromatographie d’affinité (colonne de Nickel, colonne de Phényl Boronate, colonne de Lectine), Réalisation et utilisation de colonne d’immuno-affinité, Précipitation sulfate d’ammonium.
• Analyse : Electrophorèse sur gel acrylamide (Coomassie et Nitrate d’argent) et Western blot, Dosage protéique (ELISA, Coomassie, Acide Bicinchoninique).
• Protéomique : Spectrométrie de masse (MALDI-TOF).
Biologie cellulaire :
• Culture : Cellules Humaines, Cellules Végétales, Levures, Bactéries (E.coli et agrobactérie).
• Préparation et Test : Fractionnement cellulaire, Immunofluorescence couplé à de l’hybridation in situ en fluorescence (IF-FISH), Test de transactivation de protéines en levure, Utilisation de système réplicon du virus de l’Hépatite C (HCV).
Bio-informatique :
• Construction plasmidique : Vector NTI, Serial Cloner, Oligo Analyzer.
• Analyse de séquençage ADN : BioEdit, Blast.
• Pilotage de système FPLC : Unicorn.
• Logiciel de protéomique : Data Explorer et Protein Prospector.
Projet ANR :
• Suivi de projet multi-partenarial.
• Présentation de résultats.
• Participation à la préparation de rapports intermédiaires.
Encadrement :
• Stagiaire M1, de Novembre à Décembre 2011 et de Novembre à Décembre 2012.
• Encadrement technique, réalisation et suivi du projet.
Responsabilités Techniques :
• Responsable des appareils FPLC du Laboratoire de Recherche en Science Végétale (LRSV),
Vie de laboratoire :
• Participation à des réunions de groupe
• Participation à des séminaires de laboratoires
Mes compétences :
Protéomique
Biologie moléculaire
Biologie végétale
Biochimie des protéines
