Mes compétences :
Python
Visualisation 3D
Bash Script
Modélisation simulation
Entreprises
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)
- Doctorante en modélisation moléculaire
2012 - maintenantSimulations de dynamiques moléculaires
Institut des Biomolécules Max Mousseron (Montpellier)
- Bioinformatique structurale
2012 - 2012Modélisation des récepteurs couplés aux protéines G
Article:
Conformational restriction of G-proteins Coupled Receptors (GPCRs) upon complexation to G-proteins: a putative activation mode of GPCRs ?, FEBS Letters, August 19, 2013,
Maxime Louet, Esra Karakas, Alexandre Perret, David Perahia, Jean Martinez, Nicolas Floquet.
Centre for drug research - Faculty of Pharmacy (Helsinki, Finland)
- Bioinformatique structurale
2011 - 2011Les effets de la modification de sel et de la concentration de sel sur la structure de surface de liposome pégylé.
- Simulations moléculaires et analyse : GROMACS
- Utilisation d'un cluster de calcul
- Outils de visualisation : VMD, PyMOL
- Analyse statistique : R
- Programme de traçage: Gnuplot
- Kit d'outils informatiques pour la conception moléculaire et l'analyse: Sybyl
- Système d'exploitation : Unix
- Travail de groupe
- Préparation et présentation d'un poster scientifique au Workshop Computational methods in protein science
Article :
Molecular Dynamics Simulation of PEGylated Bilayer Interacting with Salt Ions: A Model of the Liposome Surface in the Bloodstream, The Journal of Physical Chemistry B, March 15, 2012,
Aniket Magarkar, Esra Karakas, Michał Stepniewski, Tomasz Rog, ́ and Alex Bunker.
2010 - 2010Etude statistique sur les modèles énergétiques de petits ARNs
- Programmation : Python et bash
- Outil de visualisation : VMD
- Programme de traçage : Gnuplot
- Système d'exploitation : Unix
- Etude sur le modèle "gros grain"
